Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWN8

ARAP3, Arf-GAP with Rho-GAP domain, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARAP3Q8WWN8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC46.04■■■■■ 4.96
ARAP3Q8WWN8 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.02■■■■■ 4.96
ARAP3Q8WWN8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.02■■■■■ 4.96
ARAP3Q8WWN8 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC45.97■■■■■ 4.95
ARAP3Q8WWN8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC45.97■■■■■ 4.95
ARAP3Q8WWN8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.95■■■■■ 4.95
ARAP3Q8WWN8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.93■■■■■ 4.94
ARAP3Q8WWN8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC45.9■■■■■ 4.94
ARAP3Q8WWN8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC45.82■■■■■ 4.92
ARAP3Q8WWN8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.79■■■■■ 4.92
ARAP3Q8WWN8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC45.7■■■■■ 4.91
ARAP3Q8WWN8 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.62■■■■■ 4.89
ARAP3Q8WWN8 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.57■■■■■ 4.88
ARAP3Q8WWN8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC45.52■■■■■ 4.88
ARAP3Q8WWN8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC45.52■■■■■ 4.88
ARAP3Q8WWN8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC45.46■■■■■ 4.87
ARAP3Q8WWN8 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC45.45■■■■■ 4.87
ARAP3Q8WWN8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.44■■■■■ 4.86
ARAP3Q8WWN8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.43■■■■■ 4.86
ARAP3Q8WWN8 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45.43■■■■■ 4.86
ARAP3Q8WWN8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC45.42■■■■■ 4.86
ARAP3Q8WWN8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC45.4■■■■■ 4.86
ARAP3Q8WWN8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.35■■■■■ 4.85
ARAP3Q8WWN8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC45.35■■■■■ 4.85
ARAP3Q8WWN8 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.31■■■■■ 4.84
ARAP3Q8WWN8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.29■■■■■ 4.84
ARAP3Q8WWN8 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.29■■■■■ 4.84
ARAP3Q8WWN8 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC45.23■■■■■ 4.83
ARAP3Q8WWN8 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC45.23■■■■■ 4.83
ARAP3Q8WWN8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC45.2■■■■■ 4.83
ARAP3Q8WWN8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.82
ARAP3Q8WWN8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.13■■■■■ 4.81
ARAP3Q8WWN8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC45.11■■■■■ 4.81
ARAP3Q8WWN8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.09■■■■■ 4.81
ARAP3Q8WWN8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.07■■■■■ 4.81
ARAP3Q8WWN8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC45.04■■■■■ 4.8
ARAP3Q8WWN8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
ARAP3Q8WWN8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC44.99■■■■■ 4.79
ARAP3Q8WWN8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC44.97■■■■■ 4.79
ARAP3Q8WWN8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.96■■■■■ 4.79
ARAP3Q8WWN8 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.78
ARAP3Q8WWN8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC44.92■■■■■ 4.78
ARAP3Q8WWN8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.91■■■■■ 4.78
ARAP3Q8WWN8 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC44.91■■■■■ 4.78
ARAP3Q8WWN8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC44.91■■■■■ 4.78
ARAP3Q8WWN8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.78
ARAP3Q8WWN8 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.77
ARAP3Q8WWN8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC44.87■■■■■ 4.77
ARAP3Q8WWN8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC44.87■■■■■ 4.77
ARAP3Q8WWN8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.86■■■■■ 4.77
ARAP3Q8WWN8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC44.79■■■■■ 4.76
ARAP3Q8WWN8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC44.77■■■■■ 4.76
ARAP3Q8WWN8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC44.74■■■■■ 4.75
ARAP3Q8WWN8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC44.74■■■■■ 4.75
ARAP3Q8WWN8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.7■■■■■ 4.75
ARAP3Q8WWN8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC44.68■■■■■ 4.74
ARAP3Q8WWN8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC44.66■■■■■ 4.74
ARAP3Q8WWN8 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.63■■■■■ 4.73
ARAP3Q8WWN8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC44.63■■■■■ 4.73
ARAP3Q8WWN8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC44.62■■■■■ 4.73
ARAP3Q8WWN8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.57■■■■■ 4.73
ARAP3Q8WWN8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC44.56■■■■■ 4.72
ARAP3Q8WWN8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC44.55■■■■■ 4.72
ARAP3Q8WWN8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC44.54■■■■■ 4.72
ARAP3Q8WWN8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
ARAP3Q8WWN8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
ARAP3Q8WWN8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
ARAP3Q8WWN8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC44.41■■■■■ 4.7
ARAP3Q8WWN8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC44.41■■■■■ 4.7
ARAP3Q8WWN8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.39■■■■■ 4.7
ARAP3Q8WWN8 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.37■■■■■ 4.69
ARAP3Q8WWN8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.34■■■■■ 4.69
ARAP3Q8WWN8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC44.34■■■■■ 4.69
ARAP3Q8WWN8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
ARAP3Q8WWN8 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC44.3■■■■■ 4.68
ARAP3Q8WWN8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.29■■■■■ 4.68
ARAP3Q8WWN8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
ARAP3Q8WWN8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
ARAP3Q8WWN8 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
ARAP3Q8WWN8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
ARAP3Q8WWN8 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.21■■■■■ 4.67
ARAP3Q8WWN8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC44.16■■■■■ 4.66
ARAP3Q8WWN8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
ARAP3Q8WWN8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC44.14■■■■■ 4.66
ARAP3Q8WWN8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC44.14■■■■■ 4.66
ARAP3Q8WWN8 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
ARAP3Q8WWN8 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC44.13■■■■■ 4.65
ARAP3Q8WWN8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.65
ARAP3Q8WWN8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC44.12■■■■■ 4.65
ARAP3Q8WWN8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC44.1■■■■■ 4.65
ARAP3Q8WWN8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
ARAP3Q8WWN8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC44.09■■■■■ 4.65
ARAP3Q8WWN8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC44.07■■■■■ 4.65
ARAP3Q8WWN8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.65
ARAP3Q8WWN8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
ARAP3Q8WWN8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
ARAP3Q8WWN8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC43.99■■■■■ 4.63
ARAP3Q8WWN8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
ARAP3Q8WWN8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
ARAP3Q8WWN8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.97■■■■■ 4.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms