Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC41

RNF217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF217Q8TC41 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RNF217Q8TC41 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RNF217Q8TC41 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RNF217Q8TC41 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RNF217Q8TC41 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RNF217Q8TC41 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RNF217Q8TC41 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RNF217Q8TC41 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RNF217Q8TC41 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RNF217Q8TC41 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RNF217Q8TC41 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RNF217Q8TC41 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RNF217Q8TC41 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RNF217Q8TC41 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RNF217Q8TC41 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RNF217Q8TC41 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RNF217Q8TC41 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RNF217Q8TC41 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RNF217Q8TC41 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RNF217Q8TC41 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RNF217Q8TC41 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RNF217Q8TC41 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
RNF217Q8TC41 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RNF217Q8TC41 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RNF217Q8TC41 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RNF217Q8TC41 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RNF217Q8TC41 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RNF217Q8TC41 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RNF217Q8TC41 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF217Q8TC41 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RNF217Q8TC41 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RNF217Q8TC41 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RNF217Q8TC41 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
RNF217Q8TC41 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RNF217Q8TC41 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RNF217Q8TC41 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RNF217Q8TC41 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RNF217Q8TC41 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RNF217Q8TC41 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RNF217Q8TC41 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RNF217Q8TC41 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RNF217Q8TC41 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RNF217Q8TC41 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RNF217Q8TC41 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RNF217Q8TC41 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RNF217Q8TC41 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RNF217Q8TC41 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RNF217Q8TC41 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RNF217Q8TC41 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RNF217Q8TC41 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RNF217Q8TC41 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
RNF217Q8TC41 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RNF217Q8TC41 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RNF217Q8TC41 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RNF217Q8TC41 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RNF217Q8TC41 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RNF217Q8TC41 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
RNF217Q8TC41 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RNF217Q8TC41 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RNF217Q8TC41 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RNF217Q8TC41 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RNF217Q8TC41 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RNF217Q8TC41 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RNF217Q8TC41 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RNF217Q8TC41 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RNF217Q8TC41 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RNF217Q8TC41 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
RNF217Q8TC41 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RNF217Q8TC41 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RNF217Q8TC41 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RNF217Q8TC41 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RNF217Q8TC41 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RNF217Q8TC41 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RNF217Q8TC41 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RNF217Q8TC41 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RNF217Q8TC41 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RNF217Q8TC41 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RNF217Q8TC41 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RNF217Q8TC41 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RNF217Q8TC41 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RNF217Q8TC41 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RNF217Q8TC41 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RNF217Q8TC41 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RNF217Q8TC41 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RNF217Q8TC41 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RNF217Q8TC41 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RNF217Q8TC41 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RNF217Q8TC41 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RNF217Q8TC41 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RNF217Q8TC41 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RNF217Q8TC41 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RNF217Q8TC41 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RNF217Q8TC41 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RNF217Q8TC41 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RNF217Q8TC41 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RNF217Q8TC41 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RNF217Q8TC41 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RNF217Q8TC41 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RNF217Q8TC41 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RNF217Q8TC41 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms