Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHU2

CFAP61, Cilia- and flagella-associated protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 1,237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP61Q8NHU2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CFAP61Q8NHU2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CFAP61Q8NHU2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CFAP61Q8NHU2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CFAP61Q8NHU2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CFAP61Q8NHU2 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CFAP61Q8NHU2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CFAP61Q8NHU2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CFAP61Q8NHU2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CFAP61Q8NHU2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CFAP61Q8NHU2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CFAP61Q8NHU2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CFAP61Q8NHU2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CFAP61Q8NHU2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CFAP61Q8NHU2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CFAP61Q8NHU2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CFAP61Q8NHU2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CFAP61Q8NHU2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CFAP61Q8NHU2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CFAP61Q8NHU2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CFAP61Q8NHU2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CFAP61Q8NHU2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CFAP61Q8NHU2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CFAP61Q8NHU2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CFAP61Q8NHU2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CFAP61Q8NHU2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CFAP61Q8NHU2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CFAP61Q8NHU2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CFAP61Q8NHU2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CFAP61Q8NHU2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CFAP61Q8NHU2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CFAP61Q8NHU2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CFAP61Q8NHU2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CFAP61Q8NHU2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFAP61Q8NHU2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFAP61Q8NHU2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFAP61Q8NHU2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CFAP61Q8NHU2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CFAP61Q8NHU2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CFAP61Q8NHU2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CFAP61Q8NHU2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CFAP61Q8NHU2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFAP61Q8NHU2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CFAP61Q8NHU2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CFAP61Q8NHU2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CFAP61Q8NHU2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CFAP61Q8NHU2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CFAP61Q8NHU2 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CFAP61Q8NHU2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CFAP61Q8NHU2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CFAP61Q8NHU2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CFAP61Q8NHU2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CFAP61Q8NHU2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CFAP61Q8NHU2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFAP61Q8NHU2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFAP61Q8NHU2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFAP61Q8NHU2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFAP61Q8NHU2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFAP61Q8NHU2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFAP61Q8NHU2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFAP61Q8NHU2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFAP61Q8NHU2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFAP61Q8NHU2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CFAP61Q8NHU2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CFAP61Q8NHU2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CFAP61Q8NHU2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CFAP61Q8NHU2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CFAP61Q8NHU2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CFAP61Q8NHU2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CFAP61Q8NHU2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CFAP61Q8NHU2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CFAP61Q8NHU2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CFAP61Q8NHU2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CFAP61Q8NHU2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CFAP61Q8NHU2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFAP61Q8NHU2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFAP61Q8NHU2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFAP61Q8NHU2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFAP61Q8NHU2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CFAP61Q8NHU2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFAP61Q8NHU2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CFAP61Q8NHU2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CFAP61Q8NHU2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CFAP61Q8NHU2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CFAP61Q8NHU2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CFAP61Q8NHU2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CFAP61Q8NHU2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CFAP61Q8NHU2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CFAP61Q8NHU2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFAP61Q8NHU2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFAP61Q8NHU2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CFAP61Q8NHU2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CFAP61Q8NHU2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CFAP61Q8NHU2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CFAP61Q8NHU2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CFAP61Q8NHU2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CFAP61Q8NHU2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CFAP61Q8NHU2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CFAP61Q8NHU2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CFAP61Q8NHU2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms