Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BEST4Q8NFU0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
BEST4Q8NFU0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BEST4Q8NFU0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BEST4Q8NFU0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BEST4Q8NFU0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BEST4Q8NFU0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BEST4Q8NFU0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BEST4Q8NFU0 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BEST4Q8NFU0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BEST4Q8NFU0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BEST4Q8NFU0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BEST4Q8NFU0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BEST4Q8NFU0 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BEST4Q8NFU0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BEST4Q8NFU0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BEST4Q8NFU0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BEST4Q8NFU0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BEST4Q8NFU0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BEST4Q8NFU0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BEST4Q8NFU0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BEST4Q8NFU0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
BEST4Q8NFU0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BEST4Q8NFU0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BEST4Q8NFU0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BEST4Q8NFU0 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BEST4Q8NFU0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BEST4Q8NFU0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BEST4Q8NFU0 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BEST4Q8NFU0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BEST4Q8NFU0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BEST4Q8NFU0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BEST4Q8NFU0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BEST4Q8NFU0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BEST4Q8NFU0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
BEST4Q8NFU0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BEST4Q8NFU0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BEST4Q8NFU0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BEST4Q8NFU0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BEST4Q8NFU0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BEST4Q8NFU0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BEST4Q8NFU0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BEST4Q8NFU0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BEST4Q8NFU0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BEST4Q8NFU0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BEST4Q8NFU0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BEST4Q8NFU0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BEST4Q8NFU0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BEST4Q8NFU0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BEST4Q8NFU0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BEST4Q8NFU0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BEST4Q8NFU0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BEST4Q8NFU0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BEST4Q8NFU0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BEST4Q8NFU0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BEST4Q8NFU0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BEST4Q8NFU0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BEST4Q8NFU0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BEST4Q8NFU0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BEST4Q8NFU0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BEST4Q8NFU0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BEST4Q8NFU0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BEST4Q8NFU0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BEST4Q8NFU0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BEST4Q8NFU0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BEST4Q8NFU0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BEST4Q8NFU0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BEST4Q8NFU0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BEST4Q8NFU0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BEST4Q8NFU0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BEST4Q8NFU0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BEST4Q8NFU0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BEST4Q8NFU0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BEST4Q8NFU0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BEST4Q8NFU0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BEST4Q8NFU0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BEST4Q8NFU0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BEST4Q8NFU0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
BEST4Q8NFU0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BEST4Q8NFU0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BEST4Q8NFU0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BEST4Q8NFU0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BEST4Q8NFU0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BEST4Q8NFU0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BEST4Q8NFU0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BEST4Q8NFU0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BEST4Q8NFU0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BEST4Q8NFU0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BEST4Q8NFU0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BEST4Q8NFU0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
BEST4Q8NFU0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BEST4Q8NFU0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BEST4Q8NFU0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BEST4Q8NFU0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BEST4Q8NFU0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BEST4Q8NFU0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
BEST4Q8NFU0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BEST4Q8NFU0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BEST4Q8NFU0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BEST4Q8NFU0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms