Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0Z9

VSIG10, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG10Q8N0Z9 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC37.83■■■■□ 3.65
VSIG10Q8N0Z9 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
VSIG10Q8N0Z9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC37.8■■■■□ 3.64
VSIG10Q8N0Z9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
VSIG10Q8N0Z9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
VSIG10Q8N0Z9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC37.68■■■■□ 3.62
VSIG10Q8N0Z9 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
VSIG10Q8N0Z9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
VSIG10Q8N0Z9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC37.64■■■■□ 3.62
VSIG10Q8N0Z9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
VSIG10Q8N0Z9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
VSIG10Q8N0Z9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
VSIG10Q8N0Z9 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
VSIG10Q8N0Z9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
VSIG10Q8N0Z9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC37.53■■■■□ 3.6
VSIG10Q8N0Z9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.6
VSIG10Q8N0Z9 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
VSIG10Q8N0Z9 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
VSIG10Q8N0Z9 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
VSIG10Q8N0Z9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
VSIG10Q8N0Z9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
VSIG10Q8N0Z9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
VSIG10Q8N0Z9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
VSIG10Q8N0Z9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
VSIG10Q8N0Z9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC37.34■■■■□ 3.57
VSIG10Q8N0Z9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
VSIG10Q8N0Z9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.56
VSIG10Q8N0Z9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
VSIG10Q8N0Z9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
VSIG10Q8N0Z9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
VSIG10Q8N0Z9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
VSIG10Q8N0Z9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
VSIG10Q8N0Z9 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
VSIG10Q8N0Z9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.55
VSIG10Q8N0Z9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
VSIG10Q8N0Z9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
VSIG10Q8N0Z9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
VSIG10Q8N0Z9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
VSIG10Q8N0Z9 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC37.18■■■■□ 3.54
VSIG10Q8N0Z9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC37.09■■■■□ 3.53
VSIG10Q8N0Z9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
VSIG10Q8N0Z9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC37.06■■■■□ 3.52
VSIG10Q8N0Z9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
VSIG10Q8N0Z9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
VSIG10Q8N0Z9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
VSIG10Q8N0Z9 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
VSIG10Q8N0Z9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
VSIG10Q8N0Z9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC36.97■■■■□ 3.51
VSIG10Q8N0Z9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
VSIG10Q8N0Z9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
VSIG10Q8N0Z9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
VSIG10Q8N0Z9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
VSIG10Q8N0Z9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
VSIG10Q8N0Z9 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
VSIG10Q8N0Z9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
VSIG10Q8N0Z9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
VSIG10Q8N0Z9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
VSIG10Q8N0Z9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
VSIG10Q8N0Z9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
VSIG10Q8N0Z9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
VSIG10Q8N0Z9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
VSIG10Q8N0Z9 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
VSIG10Q8N0Z9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
VSIG10Q8N0Z9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
VSIG10Q8N0Z9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
VSIG10Q8N0Z9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
VSIG10Q8N0Z9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
VSIG10Q8N0Z9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
VSIG10Q8N0Z9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
VSIG10Q8N0Z9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
VSIG10Q8N0Z9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
VSIG10Q8N0Z9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
VSIG10Q8N0Z9 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
VSIG10Q8N0Z9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
VSIG10Q8N0Z9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
VSIG10Q8N0Z9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
VSIG10Q8N0Z9 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
VSIG10Q8N0Z9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
VSIG10Q8N0Z9 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
VSIG10Q8N0Z9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
VSIG10Q8N0Z9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
VSIG10Q8N0Z9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
VSIG10Q8N0Z9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
VSIG10Q8N0Z9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
VSIG10Q8N0Z9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
VSIG10Q8N0Z9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
VSIG10Q8N0Z9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
VSIG10Q8N0Z9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
VSIG10Q8N0Z9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
VSIG10Q8N0Z9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
VSIG10Q8N0Z9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
VSIG10Q8N0Z9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
VSIG10Q8N0Z9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
VSIG10Q8N0Z9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
VSIG10Q8N0Z9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
VSIG10Q8N0Z9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
VSIG10Q8N0Z9 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
VSIG10Q8N0Z9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
VSIG10Q8N0Z9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
VSIG10Q8N0Z9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.6 ms