Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVL6

P3H3, Prolyl 3-hydroxylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H3Q8IVL6 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.16■■■■■ 5.14
P3H3Q8IVL6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC47.1■■■■■ 5.13
P3H3Q8IVL6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.08■■■■■ 5.13
P3H3Q8IVL6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC47.07■■■■■ 5.13
P3H3Q8IVL6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC47.07■■■■■ 5.13
P3H3Q8IVL6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC47.05■■■■■ 5.12
P3H3Q8IVL6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.95■■■■■ 5.11
P3H3Q8IVL6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.92■■■■■ 5.1
P3H3Q8IVL6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC46.91■■■■■ 5.1
P3H3Q8IVL6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.86■■■■■ 5.09
P3H3Q8IVL6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC46.84■■■■■ 5.09
P3H3Q8IVL6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC46.83■■■■■ 5.09
P3H3Q8IVL6 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.83■■■■■ 5.09
P3H3Q8IVL6 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.82■■■■■ 5.09
P3H3Q8IVL6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC46.82■■■■■ 5.09
P3H3Q8IVL6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC46.79■■■■■ 5.08
P3H3Q8IVL6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC46.72■■■■■ 5.07
P3H3Q8IVL6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC46.72■■■■■ 5.07
P3H3Q8IVL6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC46.69■■■■■ 5.06
P3H3Q8IVL6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.69■■■■■ 5.06
P3H3Q8IVL6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.67■■■■■ 5.06
P3H3Q8IVL6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC46.66■■■■■ 5.06
P3H3Q8IVL6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC46.62■■■■■ 5.05
P3H3Q8IVL6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC46.58■■■■■ 5.05
P3H3Q8IVL6 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.57■■■■■ 5.05
P3H3Q8IVL6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC46.49■■■■■ 5.03
P3H3Q8IVL6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC46.47■■■■■ 5.03
P3H3Q8IVL6 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.47■■■■■ 5.03
P3H3Q8IVL6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.43■■■■■ 5.02
P3H3Q8IVL6 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC46.42■■■■■ 5.02
P3H3Q8IVL6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC46.41■■■■■ 5.02
P3H3Q8IVL6 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC46.4■■■■■ 5.02
P3H3Q8IVL6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.34■■■■■ 5.01
P3H3Q8IVL6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC46.3■■■■■ 5
P3H3Q8IVL6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC46.28■■■■■ 5
P3H3Q8IVL6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.28■■■■■ 5
P3H3Q8IVL6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC46.27■■■■■ 5
P3H3Q8IVL6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.22■■■■■ 4.99
P3H3Q8IVL6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC46.22■■■■■ 4.99
P3H3Q8IVL6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC46.22■■■■■ 4.99
P3H3Q8IVL6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.17■■■■■ 4.98
P3H3Q8IVL6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC46.17■■■■■ 4.98
P3H3Q8IVL6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC46.17■■■■■ 4.98
P3H3Q8IVL6 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.14■■■■■ 4.98
P3H3Q8IVL6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.12■■■■■ 4.97
P3H3Q8IVL6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC46.1■■■■■ 4.97
P3H3Q8IVL6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.07■■■■■ 4.97
P3H3Q8IVL6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC46.07■■■■■ 4.97
P3H3Q8IVL6 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC46.06■■■■■ 4.96
P3H3Q8IVL6 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC46.01■■■■■ 4.96
P3H3Q8IVL6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.01■■■■■ 4.96
P3H3Q8IVL6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC45.99■■■■■ 4.95
P3H3Q8IVL6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC45.97■■■■■ 4.95
P3H3Q8IVL6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC45.97■■■■■ 4.95
P3H3Q8IVL6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC45.97■■■■■ 4.95
P3H3Q8IVL6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC45.97■■■■■ 4.95
P3H3Q8IVL6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC45.96■■■■■ 4.95
P3H3Q8IVL6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.95■■■■■ 4.95
P3H3Q8IVL6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.95■■■■■ 4.95
P3H3Q8IVL6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC45.94■■■■■ 4.94
P3H3Q8IVL6 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC45.92■■■■■ 4.94
P3H3Q8IVL6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.89■■■■■ 4.94
P3H3Q8IVL6 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.88■■■■■ 4.94
P3H3Q8IVL6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC45.83■■■■■ 4.93
P3H3Q8IVL6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC45.82■■■■■ 4.93
P3H3Q8IVL6 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.82■■■■■ 4.93
P3H3Q8IVL6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.74■■■■■ 4.91
P3H3Q8IVL6 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC45.74■■■■■ 4.91
P3H3Q8IVL6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC45.73■■■■■ 4.91
P3H3Q8IVL6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.71■■■■■ 4.91
P3H3Q8IVL6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.7■■■■■ 4.91
P3H3Q8IVL6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.69■■■■■ 4.9
P3H3Q8IVL6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC45.68■■■■■ 4.9
P3H3Q8IVL6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.62■■■■■ 4.89
P3H3Q8IVL6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC45.59■■■■■ 4.89
P3H3Q8IVL6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC45.59■■■■■ 4.89
P3H3Q8IVL6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
P3H3Q8IVL6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC45.53■■■■■ 4.88
P3H3Q8IVL6 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.51■■■■■ 4.88
P3H3Q8IVL6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.49■■■■■ 4.87
P3H3Q8IVL6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.46■■■■■ 4.87
P3H3Q8IVL6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.43■■■■■ 4.86
P3H3Q8IVL6 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC45.43■■■■■ 4.86
P3H3Q8IVL6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC45.4■■■■■ 4.86
P3H3Q8IVL6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.38■■■■■ 4.86
P3H3Q8IVL6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC45.36■■■■■ 4.85
P3H3Q8IVL6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.33■■■■■ 4.85
P3H3Q8IVL6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC45.33■■■■■ 4.85
P3H3Q8IVL6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC45.33■■■■■ 4.85
P3H3Q8IVL6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.32■■■■■ 4.85
P3H3Q8IVL6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.3■■■■■ 4.84
P3H3Q8IVL6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.27■■■■■ 4.84
P3H3Q8IVL6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC45.2■■■■■ 4.83
P3H3Q8IVL6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC45.19■■■■■ 4.82
P3H3Q8IVL6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.17■■■■■ 4.82
P3H3Q8IVL6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC45.17■■■■■ 4.82
P3H3Q8IVL6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC45.17■■■■■ 4.82
P3H3Q8IVL6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.16■■■■■ 4.82
P3H3Q8IVL6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.16■■■■■ 4.82
P3H3Q8IVL6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC45.16■■■■■ 4.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms