Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUH8

SPPL2C, Signal peptide peptidase-like 2C, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPPL2CQ8IUH8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SPPL2CQ8IUH8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SPPL2CQ8IUH8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SPPL2CQ8IUH8 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SPPL2CQ8IUH8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SPPL2CQ8IUH8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SPPL2CQ8IUH8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SPPL2CQ8IUH8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SPPL2CQ8IUH8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SPPL2CQ8IUH8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
SPPL2CQ8IUH8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPPL2CQ8IUH8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPPL2CQ8IUH8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPPL2CQ8IUH8 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPPL2CQ8IUH8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPPL2CQ8IUH8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPPL2CQ8IUH8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SPPL2CQ8IUH8 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SPPL2CQ8IUH8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SPPL2CQ8IUH8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SPPL2CQ8IUH8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SPPL2CQ8IUH8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPPL2CQ8IUH8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SPPL2CQ8IUH8 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPPL2CQ8IUH8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPPL2CQ8IUH8 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPPL2CQ8IUH8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPPL2CQ8IUH8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SPPL2CQ8IUH8 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SPPL2CQ8IUH8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPPL2CQ8IUH8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPPL2CQ8IUH8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPPL2CQ8IUH8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPPL2CQ8IUH8 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPPL2CQ8IUH8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPPL2CQ8IUH8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPPL2CQ8IUH8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SPPL2CQ8IUH8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SPPL2CQ8IUH8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SPPL2CQ8IUH8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPPL2CQ8IUH8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPPL2CQ8IUH8 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPPL2CQ8IUH8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPPL2CQ8IUH8 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SPPL2CQ8IUH8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPPL2CQ8IUH8 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SPPL2CQ8IUH8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SPPL2CQ8IUH8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SPPL2CQ8IUH8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SPPL2CQ8IUH8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SPPL2CQ8IUH8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SPPL2CQ8IUH8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPPL2CQ8IUH8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPPL2CQ8IUH8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SPPL2CQ8IUH8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SPPL2CQ8IUH8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SPPL2CQ8IUH8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SPPL2CQ8IUH8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SPPL2CQ8IUH8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SPPL2CQ8IUH8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPPL2CQ8IUH8 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPPL2CQ8IUH8 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SPPL2CQ8IUH8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SPPL2CQ8IUH8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SPPL2CQ8IUH8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SPPL2CQ8IUH8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SPPL2CQ8IUH8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPPL2CQ8IUH8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SPPL2CQ8IUH8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SPPL2CQ8IUH8 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SPPL2CQ8IUH8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SPPL2CQ8IUH8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPPL2CQ8IUH8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPPL2CQ8IUH8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPPL2CQ8IUH8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPPL2CQ8IUH8 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPPL2CQ8IUH8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPPL2CQ8IUH8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPPL2CQ8IUH8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPPL2CQ8IUH8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPPL2CQ8IUH8 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPPL2CQ8IUH8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPPL2CQ8IUH8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPPL2CQ8IUH8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPPL2CQ8IUH8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPPL2CQ8IUH8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPPL2CQ8IUH8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPPL2CQ8IUH8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPPL2CQ8IUH8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPPL2CQ8IUH8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPPL2CQ8IUH8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPPL2CQ8IUH8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPPL2CQ8IUH8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPPL2CQ8IUH8 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPPL2CQ8IUH8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPPL2CQ8IUH8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPPL2CQ8IUH8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPPL2CQ8IUH8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPPL2CQ8IUH8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPPL2CQ8IUH8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms