Protein–RNA interactions for Protein: Q6X4T0

C12orf54, Uncharacterized protein C12orf54, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf54Q6X4T0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C12orf54Q6X4T0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C12orf54Q6X4T0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C12orf54Q6X4T0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C12orf54Q6X4T0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C12orf54Q6X4T0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C12orf54Q6X4T0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C12orf54Q6X4T0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C12orf54Q6X4T0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
C12orf54Q6X4T0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
C12orf54Q6X4T0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C12orf54Q6X4T0 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C12orf54Q6X4T0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C12orf54Q6X4T0 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C12orf54Q6X4T0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C12orf54Q6X4T0 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C12orf54Q6X4T0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C12orf54Q6X4T0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
C12orf54Q6X4T0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C12orf54Q6X4T0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C12orf54Q6X4T0 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C12orf54Q6X4T0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
C12orf54Q6X4T0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C12orf54Q6X4T0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C12orf54Q6X4T0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C12orf54Q6X4T0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C12orf54Q6X4T0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C12orf54Q6X4T0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
C12orf54Q6X4T0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C12orf54Q6X4T0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C12orf54Q6X4T0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C12orf54Q6X4T0 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C12orf54Q6X4T0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C12orf54Q6X4T0 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C12orf54Q6X4T0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C12orf54Q6X4T0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C12orf54Q6X4T0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C12orf54Q6X4T0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
C12orf54Q6X4T0 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
C12orf54Q6X4T0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23■■□□□ 1.27
C12orf54Q6X4T0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C12orf54Q6X4T0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C12orf54Q6X4T0 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C12orf54Q6X4T0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C12orf54Q6X4T0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C12orf54Q6X4T0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C12orf54Q6X4T0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C12orf54Q6X4T0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C12orf54Q6X4T0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C12orf54Q6X4T0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C12orf54Q6X4T0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C12orf54Q6X4T0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C12orf54Q6X4T0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C12orf54Q6X4T0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C12orf54Q6X4T0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C12orf54Q6X4T0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C12orf54Q6X4T0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C12orf54Q6X4T0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
C12orf54Q6X4T0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C12orf54Q6X4T0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C12orf54Q6X4T0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C12orf54Q6X4T0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C12orf54Q6X4T0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C12orf54Q6X4T0 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C12orf54Q6X4T0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C12orf54Q6X4T0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C12orf54Q6X4T0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C12orf54Q6X4T0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C12orf54Q6X4T0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C12orf54Q6X4T0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
C12orf54Q6X4T0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
C12orf54Q6X4T0 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C12orf54Q6X4T0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C12orf54Q6X4T0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C12orf54Q6X4T0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C12orf54Q6X4T0 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C12orf54Q6X4T0 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C12orf54Q6X4T0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C12orf54Q6X4T0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C12orf54Q6X4T0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C12orf54Q6X4T0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
C12orf54Q6X4T0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C12orf54Q6X4T0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C12orf54Q6X4T0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C12orf54Q6X4T0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C12orf54Q6X4T0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C12orf54Q6X4T0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C12orf54Q6X4T0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C12orf54Q6X4T0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C12orf54Q6X4T0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
C12orf54Q6X4T0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C12orf54Q6X4T0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
C12orf54Q6X4T0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C12orf54Q6X4T0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C12orf54Q6X4T0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C12orf54Q6X4T0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C12orf54Q6X4T0 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C12orf54Q6X4T0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C12orf54Q6X4T0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
C12orf54Q6X4T0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms