Protein–RNA interactions for Protein: Q6PL18

ATAD2, ATPase family AAA domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD2Q6PL18 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
ATAD2Q6PL18 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC40.64■■■■■ 4.1
ATAD2Q6PL18 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC40.64■■■■■ 4.1
ATAD2Q6PL18 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC40.61■■■■■ 4.09
ATAD2Q6PL18 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC40.61■■■■■ 4.09
ATAD2Q6PL18 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC40.61■■■■■ 4.09
ATAD2Q6PL18 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
ATAD2Q6PL18 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC40.61■■■■■ 4.09
ATAD2Q6PL18 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC40.58■■■■■ 4.09
ATAD2Q6PL18 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
ATAD2Q6PL18 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
ATAD2Q6PL18 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
ATAD2Q6PL18 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.53■■■■■ 4.08
ATAD2Q6PL18 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.49■■■■■ 4.07
ATAD2Q6PL18 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC40.45■■■■■ 4.07
ATAD2Q6PL18 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.44■■■■■ 4.06
ATAD2Q6PL18 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC40.42■■■■■ 4.06
ATAD2Q6PL18 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC40.4■■■■■ 4.06
ATAD2Q6PL18 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
ATAD2Q6PL18 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC40.35■■■■■ 4.05
ATAD2Q6PL18 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
ATAD2Q6PL18 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
ATAD2Q6PL18 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC40.31■■■■■ 4.04
ATAD2Q6PL18 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
ATAD2Q6PL18 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.03
ATAD2Q6PL18 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
ATAD2Q6PL18 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
ATAD2Q6PL18 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
ATAD2Q6PL18 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
ATAD2Q6PL18 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC40.15■■■■■ 4.02
ATAD2Q6PL18 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
ATAD2Q6PL18 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC40.12■■■■■ 4.01
ATAD2Q6PL18 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC40.12■■■■■ 4.01
ATAD2Q6PL18 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC40.12■■■■■ 4.01
ATAD2Q6PL18 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.11■■■■■ 4.01
ATAD2Q6PL18 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC40.1■■■■■ 4.01
ATAD2Q6PL18 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC40.07■■■■■ 4
ATAD2Q6PL18 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC40.06■■■■■ 4
ATAD2Q6PL18 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
ATAD2Q6PL18 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC40.03■■■■■ 4
ATAD2Q6PL18 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
ATAD2Q6PL18 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
ATAD2Q6PL18 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
ATAD2Q6PL18 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC39.92■■■■□ 3.98
ATAD2Q6PL18 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
ATAD2Q6PL18 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC39.83■■■■□ 3.97
ATAD2Q6PL18 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
ATAD2Q6PL18 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC39.81■■■■□ 3.96
ATAD2Q6PL18 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
ATAD2Q6PL18 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC39.74■■■■□ 3.95
ATAD2Q6PL18 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC39.73■■■■□ 3.95
ATAD2Q6PL18 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC39.71■■■■□ 3.95
ATAD2Q6PL18 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC39.68■■■■□ 3.94
ATAD2Q6PL18 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC39.68■■■■□ 3.94
ATAD2Q6PL18 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
ATAD2Q6PL18 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
ATAD2Q6PL18 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
ATAD2Q6PL18 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
ATAD2Q6PL18 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
ATAD2Q6PL18 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC39.57■■■■□ 3.92
ATAD2Q6PL18 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.54■■■■□ 3.92
ATAD2Q6PL18 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
ATAD2Q6PL18 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC39.5■■■■□ 3.91
ATAD2Q6PL18 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.5■■■■□ 3.91
ATAD2Q6PL18 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
ATAD2Q6PL18 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
ATAD2Q6PL18 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC39.47■■■■□ 3.91
ATAD2Q6PL18 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC39.47■■■■□ 3.91
ATAD2Q6PL18 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC39.46■■■■□ 3.91
ATAD2Q6PL18 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
ATAD2Q6PL18 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC39.46■■■■□ 3.91
ATAD2Q6PL18 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC39.46■■■■□ 3.91
ATAD2Q6PL18 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
ATAD2Q6PL18 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC39.44■■■■□ 3.9
ATAD2Q6PL18 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC39.43■■■■□ 3.9
ATAD2Q6PL18 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
ATAD2Q6PL18 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
ATAD2Q6PL18 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.39■■■■□ 3.9
ATAD2Q6PL18 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC39.34■■■■□ 3.89
ATAD2Q6PL18 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
ATAD2Q6PL18 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
ATAD2Q6PL18 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC39.31■■■■□ 3.88
ATAD2Q6PL18 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
ATAD2Q6PL18 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
ATAD2Q6PL18 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
ATAD2Q6PL18 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
ATAD2Q6PL18 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC39.23■■■■□ 3.87
ATAD2Q6PL18 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC39.21■■■■□ 3.87
ATAD2Q6PL18 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC39.21■■■■□ 3.87
ATAD2Q6PL18 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
ATAD2Q6PL18 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
ATAD2Q6PL18 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
ATAD2Q6PL18 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
ATAD2Q6PL18 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
ATAD2Q6PL18 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
ATAD2Q6PL18 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
ATAD2Q6PL18 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC39.13■■■■□ 3.85
ATAD2Q6PL18 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
ATAD2Q6PL18 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
ATAD2Q6PL18 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms