Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJ21

SPSB3, SPRY domain-containing SOCS box protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPSB3Q6PJ21 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPSB3Q6PJ21 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPSB3Q6PJ21 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPSB3Q6PJ21 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPSB3Q6PJ21 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPSB3Q6PJ21 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPSB3Q6PJ21 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPSB3Q6PJ21 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPSB3Q6PJ21 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPSB3Q6PJ21 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPSB3Q6PJ21 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPSB3Q6PJ21 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPSB3Q6PJ21 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPSB3Q6PJ21 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPSB3Q6PJ21 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPSB3Q6PJ21 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPSB3Q6PJ21 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPSB3Q6PJ21 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPSB3Q6PJ21 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPSB3Q6PJ21 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPSB3Q6PJ21 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPSB3Q6PJ21 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPSB3Q6PJ21 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPSB3Q6PJ21 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPSB3Q6PJ21 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPSB3Q6PJ21 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPSB3Q6PJ21 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPSB3Q6PJ21 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPSB3Q6PJ21 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPSB3Q6PJ21 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPSB3Q6PJ21 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SPSB3Q6PJ21 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPSB3Q6PJ21 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPSB3Q6PJ21 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPSB3Q6PJ21 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPSB3Q6PJ21 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPSB3Q6PJ21 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPSB3Q6PJ21 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPSB3Q6PJ21 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPSB3Q6PJ21 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPSB3Q6PJ21 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPSB3Q6PJ21 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPSB3Q6PJ21 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPSB3Q6PJ21 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPSB3Q6PJ21 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPSB3Q6PJ21 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPSB3Q6PJ21 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPSB3Q6PJ21 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPSB3Q6PJ21 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPSB3Q6PJ21 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPSB3Q6PJ21 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SPSB3Q6PJ21 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPSB3Q6PJ21 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPSB3Q6PJ21 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPSB3Q6PJ21 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPSB3Q6PJ21 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPSB3Q6PJ21 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPSB3Q6PJ21 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPSB3Q6PJ21 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPSB3Q6PJ21 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPSB3Q6PJ21 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPSB3Q6PJ21 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPSB3Q6PJ21 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPSB3Q6PJ21 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPSB3Q6PJ21 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPSB3Q6PJ21 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPSB3Q6PJ21 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPSB3Q6PJ21 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPSB3Q6PJ21 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPSB3Q6PJ21 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPSB3Q6PJ21 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPSB3Q6PJ21 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SPSB3Q6PJ21 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPSB3Q6PJ21 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPSB3Q6PJ21 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPSB3Q6PJ21 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPSB3Q6PJ21 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPSB3Q6PJ21 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPSB3Q6PJ21 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPSB3Q6PJ21 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPSB3Q6PJ21 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPSB3Q6PJ21 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPSB3Q6PJ21 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPSB3Q6PJ21 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPSB3Q6PJ21 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPSB3Q6PJ21 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPSB3Q6PJ21 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPSB3Q6PJ21 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPSB3Q6PJ21 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPSB3Q6PJ21 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPSB3Q6PJ21 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPSB3Q6PJ21 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPSB3Q6PJ21 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPSB3Q6PJ21 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPSB3Q6PJ21 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPSB3Q6PJ21 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPSB3Q6PJ21 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPSB3Q6PJ21 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPSB3Q6PJ21 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPSB3Q6PJ21 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms