Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1A2

LPCAT3, Lysophospholipid acyltransferase 5, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT3Q6P1A2 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LPCAT3Q6P1A2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LPCAT3Q6P1A2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LPCAT3Q6P1A2 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LPCAT3Q6P1A2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LPCAT3Q6P1A2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LPCAT3Q6P1A2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LPCAT3Q6P1A2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LPCAT3Q6P1A2 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LPCAT3Q6P1A2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LPCAT3Q6P1A2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LPCAT3Q6P1A2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LPCAT3Q6P1A2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LPCAT3Q6P1A2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LPCAT3Q6P1A2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LPCAT3Q6P1A2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LPCAT3Q6P1A2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LPCAT3Q6P1A2 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LPCAT3Q6P1A2 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LPCAT3Q6P1A2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LPCAT3Q6P1A2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LPCAT3Q6P1A2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LPCAT3Q6P1A2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LPCAT3Q6P1A2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LPCAT3Q6P1A2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LPCAT3Q6P1A2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LPCAT3Q6P1A2 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LPCAT3Q6P1A2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LPCAT3Q6P1A2 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LPCAT3Q6P1A2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LPCAT3Q6P1A2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LPCAT3Q6P1A2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LPCAT3Q6P1A2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LPCAT3Q6P1A2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LPCAT3Q6P1A2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LPCAT3Q6P1A2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LPCAT3Q6P1A2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LPCAT3Q6P1A2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LPCAT3Q6P1A2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LPCAT3Q6P1A2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LPCAT3Q6P1A2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LPCAT3Q6P1A2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LPCAT3Q6P1A2 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LPCAT3Q6P1A2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LPCAT3Q6P1A2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LPCAT3Q6P1A2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LPCAT3Q6P1A2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LPCAT3Q6P1A2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LPCAT3Q6P1A2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LPCAT3Q6P1A2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LPCAT3Q6P1A2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LPCAT3Q6P1A2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LPCAT3Q6P1A2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LPCAT3Q6P1A2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LPCAT3Q6P1A2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LPCAT3Q6P1A2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LPCAT3Q6P1A2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LPCAT3Q6P1A2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LPCAT3Q6P1A2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LPCAT3Q6P1A2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LPCAT3Q6P1A2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LPCAT3Q6P1A2 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LPCAT3Q6P1A2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LPCAT3Q6P1A2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LPCAT3Q6P1A2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LPCAT3Q6P1A2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LPCAT3Q6P1A2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LPCAT3Q6P1A2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LPCAT3Q6P1A2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LPCAT3Q6P1A2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LPCAT3Q6P1A2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LPCAT3Q6P1A2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LPCAT3Q6P1A2 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LPCAT3Q6P1A2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LPCAT3Q6P1A2 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LPCAT3Q6P1A2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LPCAT3Q6P1A2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LPCAT3Q6P1A2 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LPCAT3Q6P1A2 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LPCAT3Q6P1A2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LPCAT3Q6P1A2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LPCAT3Q6P1A2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LPCAT3Q6P1A2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LPCAT3Q6P1A2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LPCAT3Q6P1A2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LPCAT3Q6P1A2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LPCAT3Q6P1A2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LPCAT3Q6P1A2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LPCAT3Q6P1A2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LPCAT3Q6P1A2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LPCAT3Q6P1A2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LPCAT3Q6P1A2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LPCAT3Q6P1A2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LPCAT3Q6P1A2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LPCAT3Q6P1A2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LPCAT3Q6P1A2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LPCAT3Q6P1A2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LPCAT3Q6P1A2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LPCAT3Q6P1A2 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LPCAT3Q6P1A2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms