Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXR0

IRGC, Interferon-inducible GTPase 5, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGCQ6NXR0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
IRGCQ6NXR0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
IRGCQ6NXR0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
IRGCQ6NXR0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
IRGCQ6NXR0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
IRGCQ6NXR0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
IRGCQ6NXR0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
IRGCQ6NXR0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
IRGCQ6NXR0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
IRGCQ6NXR0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
IRGCQ6NXR0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
IRGCQ6NXR0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
IRGCQ6NXR0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
IRGCQ6NXR0 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
IRGCQ6NXR0 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
IRGCQ6NXR0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
IRGCQ6NXR0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
IRGCQ6NXR0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IRGCQ6NXR0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IRGCQ6NXR0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IRGCQ6NXR0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
IRGCQ6NXR0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
IRGCQ6NXR0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
IRGCQ6NXR0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
IRGCQ6NXR0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IRGCQ6NXR0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
IRGCQ6NXR0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IRGCQ6NXR0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
IRGCQ6NXR0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
IRGCQ6NXR0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
IRGCQ6NXR0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
IRGCQ6NXR0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IRGCQ6NXR0 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
IRGCQ6NXR0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
IRGCQ6NXR0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
IRGCQ6NXR0 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
IRGCQ6NXR0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IRGCQ6NXR0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IRGCQ6NXR0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
IRGCQ6NXR0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IRGCQ6NXR0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IRGCQ6NXR0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IRGCQ6NXR0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IRGCQ6NXR0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
IRGCQ6NXR0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
IRGCQ6NXR0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IRGCQ6NXR0 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
IRGCQ6NXR0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IRGCQ6NXR0 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IRGCQ6NXR0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IRGCQ6NXR0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
IRGCQ6NXR0 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IRGCQ6NXR0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
IRGCQ6NXR0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IRGCQ6NXR0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IRGCQ6NXR0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IRGCQ6NXR0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IRGCQ6NXR0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IRGCQ6NXR0 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
IRGCQ6NXR0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
IRGCQ6NXR0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
IRGCQ6NXR0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
IRGCQ6NXR0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
IRGCQ6NXR0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
IRGCQ6NXR0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
IRGCQ6NXR0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
IRGCQ6NXR0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
IRGCQ6NXR0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
IRGCQ6NXR0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
IRGCQ6NXR0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
IRGCQ6NXR0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
IRGCQ6NXR0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
IRGCQ6NXR0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
IRGCQ6NXR0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
IRGCQ6NXR0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
IRGCQ6NXR0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
IRGCQ6NXR0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
IRGCQ6NXR0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
IRGCQ6NXR0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
IRGCQ6NXR0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
IRGCQ6NXR0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
IRGCQ6NXR0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
IRGCQ6NXR0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IRGCQ6NXR0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
IRGCQ6NXR0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
IRGCQ6NXR0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
IRGCQ6NXR0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
IRGCQ6NXR0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
IRGCQ6NXR0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
IRGCQ6NXR0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
IRGCQ6NXR0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
IRGCQ6NXR0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
IRGCQ6NXR0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
IRGCQ6NXR0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
IRGCQ6NXR0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IRGCQ6NXR0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
IRGCQ6NXR0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
IRGCQ6NXR0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
IRGCQ6NXR0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
IRGCQ6NXR0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms