Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF544Q6NX49 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF544Q6NX49 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF544Q6NX49 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF544Q6NX49 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF544Q6NX49 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF544Q6NX49 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF544Q6NX49 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF544Q6NX49 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF544Q6NX49 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF544Q6NX49 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ZNF544Q6NX49 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF544Q6NX49 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF544Q6NX49 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF544Q6NX49 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF544Q6NX49 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF544Q6NX49 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ZNF544Q6NX49 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF544Q6NX49 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF544Q6NX49 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF544Q6NX49 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF544Q6NX49 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF544Q6NX49 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF544Q6NX49 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF544Q6NX49 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF544Q6NX49 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF544Q6NX49 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF544Q6NX49 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF544Q6NX49 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF544Q6NX49 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF544Q6NX49 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF544Q6NX49 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF544Q6NX49 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF544Q6NX49 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF544Q6NX49 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF544Q6NX49 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF544Q6NX49 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF544Q6NX49 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF544Q6NX49 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF544Q6NX49 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF544Q6NX49 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF544Q6NX49 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF544Q6NX49 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF544Q6NX49 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF544Q6NX49 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF544Q6NX49 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF544Q6NX49 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF544Q6NX49 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF544Q6NX49 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF544Q6NX49 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF544Q6NX49 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF544Q6NX49 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF544Q6NX49 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF544Q6NX49 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF544Q6NX49 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF544Q6NX49 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF544Q6NX49 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF544Q6NX49 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZNF544Q6NX49 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF544Q6NX49 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF544Q6NX49 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF544Q6NX49 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF544Q6NX49 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF544Q6NX49 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF544Q6NX49 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF544Q6NX49 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF544Q6NX49 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF544Q6NX49 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF544Q6NX49 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF544Q6NX49 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF544Q6NX49 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF544Q6NX49 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF544Q6NX49 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF544Q6NX49 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF544Q6NX49 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF544Q6NX49 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF544Q6NX49 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF544Q6NX49 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF544Q6NX49 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF544Q6NX49 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF544Q6NX49 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF544Q6NX49 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF544Q6NX49 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF544Q6NX49 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF544Q6NX49 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF544Q6NX49 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF544Q6NX49 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF544Q6NX49 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF544Q6NX49 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF544Q6NX49 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF544Q6NX49 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF544Q6NX49 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF544Q6NX49 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF544Q6NX49 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNF544Q6NX49 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNF544Q6NX49 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNF544Q6NX49 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZNF544Q6NX49 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZNF544Q6NX49 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF544Q6NX49 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms