Protein–RNA interactions for Protein: Q6DKI2

LGALS9C, Galectin-9C, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGALS9CQ6DKI2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LGALS9CQ6DKI2 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LGALS9CQ6DKI2 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LGALS9CQ6DKI2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LGALS9CQ6DKI2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LGALS9CQ6DKI2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LGALS9CQ6DKI2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
LGALS9CQ6DKI2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LGALS9CQ6DKI2 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LGALS9CQ6DKI2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LGALS9CQ6DKI2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LGALS9CQ6DKI2 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LGALS9CQ6DKI2 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LGALS9CQ6DKI2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LGALS9CQ6DKI2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LGALS9CQ6DKI2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LGALS9CQ6DKI2 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LGALS9CQ6DKI2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LGALS9CQ6DKI2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LGALS9CQ6DKI2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LGALS9CQ6DKI2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LGALS9CQ6DKI2 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LGALS9CQ6DKI2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LGALS9CQ6DKI2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LGALS9CQ6DKI2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LGALS9CQ6DKI2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LGALS9CQ6DKI2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LGALS9CQ6DKI2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LGALS9CQ6DKI2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LGALS9CQ6DKI2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LGALS9CQ6DKI2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LGALS9CQ6DKI2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LGALS9CQ6DKI2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LGALS9CQ6DKI2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LGALS9CQ6DKI2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LGALS9CQ6DKI2 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
LGALS9CQ6DKI2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LGALS9CQ6DKI2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LGALS9CQ6DKI2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LGALS9CQ6DKI2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LGALS9CQ6DKI2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LGALS9CQ6DKI2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LGALS9CQ6DKI2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LGALS9CQ6DKI2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LGALS9CQ6DKI2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LGALS9CQ6DKI2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LGALS9CQ6DKI2 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LGALS9CQ6DKI2 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LGALS9CQ6DKI2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LGALS9CQ6DKI2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LGALS9CQ6DKI2 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LGALS9CQ6DKI2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LGALS9CQ6DKI2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LGALS9CQ6DKI2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LGALS9CQ6DKI2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LGALS9CQ6DKI2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LGALS9CQ6DKI2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LGALS9CQ6DKI2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LGALS9CQ6DKI2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LGALS9CQ6DKI2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LGALS9CQ6DKI2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
LGALS9CQ6DKI2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
LGALS9CQ6DKI2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LGALS9CQ6DKI2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LGALS9CQ6DKI2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LGALS9CQ6DKI2 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LGALS9CQ6DKI2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LGALS9CQ6DKI2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LGALS9CQ6DKI2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LGALS9CQ6DKI2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LGALS9CQ6DKI2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
LGALS9CQ6DKI2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LGALS9CQ6DKI2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LGALS9CQ6DKI2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LGALS9CQ6DKI2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LGALS9CQ6DKI2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LGALS9CQ6DKI2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LGALS9CQ6DKI2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LGALS9CQ6DKI2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LGALS9CQ6DKI2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LGALS9CQ6DKI2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LGALS9CQ6DKI2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LGALS9CQ6DKI2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LGALS9CQ6DKI2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LGALS9CQ6DKI2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LGALS9CQ6DKI2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LGALS9CQ6DKI2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LGALS9CQ6DKI2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LGALS9CQ6DKI2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LGALS9CQ6DKI2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LGALS9CQ6DKI2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LGALS9CQ6DKI2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
LGALS9CQ6DKI2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LGALS9CQ6DKI2 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LGALS9CQ6DKI2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LGALS9CQ6DKI2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LGALS9CQ6DKI2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LGALS9CQ6DKI2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LGALS9CQ6DKI2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LGALS9CQ6DKI2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms