Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
ATL3Q6DD88 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
ATL3Q6DD88 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
ATL3Q6DD88 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ATL3Q6DD88 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
ATL3Q6DD88 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
ATL3Q6DD88 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
ATL3Q6DD88 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
ATL3Q6DD88 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
ATL3Q6DD88 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
ATL3Q6DD88 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.86
ATL3Q6DD88 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
ATL3Q6DD88 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
ATL3Q6DD88 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
ATL3Q6DD88 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
ATL3Q6DD88 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.85■■■□□ 2.85
ATL3Q6DD88 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
ATL3Q6DD88 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
ATL3Q6DD88 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
ATL3Q6DD88 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
ATL3Q6DD88 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
ATL3Q6DD88 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
ATL3Q6DD88 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
ATL3Q6DD88 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
ATL3Q6DD88 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
ATL3Q6DD88 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
ATL3Q6DD88 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
ATL3Q6DD88 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
ATL3Q6DD88 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
ATL3Q6DD88 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
ATL3Q6DD88 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ATL3Q6DD88 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ATL3Q6DD88 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ATL3Q6DD88 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ATL3Q6DD88 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
ATL3Q6DD88 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
ATL3Q6DD88 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
ATL3Q6DD88 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
ATL3Q6DD88 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
ATL3Q6DD88 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
ATL3Q6DD88 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
ATL3Q6DD88 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ATL3Q6DD88 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ATL3Q6DD88 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
ATL3Q6DD88 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
ATL3Q6DD88 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
ATL3Q6DD88 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
ATL3Q6DD88 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
ATL3Q6DD88 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
ATL3Q6DD88 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
ATL3Q6DD88 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
ATL3Q6DD88 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ATL3Q6DD88 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
ATL3Q6DD88 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
ATL3Q6DD88 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
ATL3Q6DD88 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ATL3Q6DD88 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ATL3Q6DD88 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ATL3Q6DD88 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
ATL3Q6DD88 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
ATL3Q6DD88 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
ATL3Q6DD88 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
ATL3Q6DD88 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
ATL3Q6DD88 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC32.3■■■□□ 2.76
ATL3Q6DD88 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ATL3Q6DD88 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
ATL3Q6DD88 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
ATL3Q6DD88 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
ATL3Q6DD88 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
ATL3Q6DD88 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ATL3Q6DD88 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ATL3Q6DD88 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
ATL3Q6DD88 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
ATL3Q6DD88 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ATL3Q6DD88 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ATL3Q6DD88 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
ATL3Q6DD88 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ATL3Q6DD88 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
ATL3Q6DD88 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ATL3Q6DD88 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
ATL3Q6DD88 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
ATL3Q6DD88 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ATL3Q6DD88 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ATL3Q6DD88 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ATL3Q6DD88 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ATL3Q6DD88 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.73
ATL3Q6DD88 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ATL3Q6DD88 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ATL3Q6DD88 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
ATL3Q6DD88 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ATL3Q6DD88 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ATL3Q6DD88 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ATL3Q6DD88 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
ATL3Q6DD88 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
ATL3Q6DD88 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
ATL3Q6DD88 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC31.96■■■□□ 2.71
ATL3Q6DD88 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
ATL3Q6DD88 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
ATL3Q6DD88 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
ATL3Q6DD88 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176.8 ms