Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATG16L1Q676U5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATG16L1Q676U5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATG16L1Q676U5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATG16L1Q676U5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATG16L1Q676U5 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATG16L1Q676U5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATG16L1Q676U5 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATG16L1Q676U5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATG16L1Q676U5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATG16L1Q676U5 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATG16L1Q676U5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATG16L1Q676U5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATG16L1Q676U5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATG16L1Q676U5 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATG16L1Q676U5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATG16L1Q676U5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATG16L1Q676U5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATG16L1Q676U5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATG16L1Q676U5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATG16L1Q676U5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATG16L1Q676U5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATG16L1Q676U5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATG16L1Q676U5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATG16L1Q676U5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATG16L1Q676U5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATG16L1Q676U5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATG16L1Q676U5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATG16L1Q676U5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATG16L1Q676U5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATG16L1Q676U5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATG16L1Q676U5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATG16L1Q676U5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATG16L1Q676U5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATG16L1Q676U5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATG16L1Q676U5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATG16L1Q676U5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATG16L1Q676U5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATG16L1Q676U5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATG16L1Q676U5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATG16L1Q676U5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATG16L1Q676U5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATG16L1Q676U5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATG16L1Q676U5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATG16L1Q676U5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATG16L1Q676U5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATG16L1Q676U5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATG16L1Q676U5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATG16L1Q676U5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATG16L1Q676U5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.08
ATG16L1Q676U5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATG16L1Q676U5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ATG16L1Q676U5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATG16L1Q676U5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATG16L1Q676U5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATG16L1Q676U5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATG16L1Q676U5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATG16L1Q676U5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATG16L1Q676U5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATG16L1Q676U5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATG16L1Q676U5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATG16L1Q676U5 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATG16L1Q676U5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATG16L1Q676U5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATG16L1Q676U5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATG16L1Q676U5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATG16L1Q676U5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATG16L1Q676U5 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATG16L1Q676U5 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATG16L1Q676U5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATG16L1Q676U5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATG16L1Q676U5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATG16L1Q676U5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
ATG16L1Q676U5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATG16L1Q676U5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATG16L1Q676U5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATG16L1Q676U5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATG16L1Q676U5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATG16L1Q676U5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATG16L1Q676U5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATG16L1Q676U5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATG16L1Q676U5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATG16L1Q676U5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATG16L1Q676U5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATG16L1Q676U5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATG16L1Q676U5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ATG16L1Q676U5 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATG16L1Q676U5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATG16L1Q676U5 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATG16L1Q676U5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATG16L1Q676U5 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATG16L1Q676U5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATG16L1Q676U5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ATG16L1Q676U5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATG16L1Q676U5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATG16L1Q676U5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATG16L1Q676U5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATG16L1Q676U5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATG16L1Q676U5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATG16L1Q676U5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms