Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTD9

GFI1B, Zinc finger protein Gfi-1b, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1BQ5VTD9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GFI1BQ5VTD9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GFI1BQ5VTD9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GFI1BQ5VTD9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GFI1BQ5VTD9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GFI1BQ5VTD9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GFI1BQ5VTD9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GFI1BQ5VTD9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GFI1BQ5VTD9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GFI1BQ5VTD9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GFI1BQ5VTD9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GFI1BQ5VTD9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GFI1BQ5VTD9 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GFI1BQ5VTD9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GFI1BQ5VTD9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GFI1BQ5VTD9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GFI1BQ5VTD9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GFI1BQ5VTD9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GFI1BQ5VTD9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GFI1BQ5VTD9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GFI1BQ5VTD9 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GFI1BQ5VTD9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GFI1BQ5VTD9 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GFI1BQ5VTD9 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GFI1BQ5VTD9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GFI1BQ5VTD9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GFI1BQ5VTD9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GFI1BQ5VTD9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GFI1BQ5VTD9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GFI1BQ5VTD9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GFI1BQ5VTD9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GFI1BQ5VTD9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GFI1BQ5VTD9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GFI1BQ5VTD9 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GFI1BQ5VTD9 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GFI1BQ5VTD9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GFI1BQ5VTD9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GFI1BQ5VTD9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GFI1BQ5VTD9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GFI1BQ5VTD9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GFI1BQ5VTD9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GFI1BQ5VTD9 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GFI1BQ5VTD9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GFI1BQ5VTD9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GFI1BQ5VTD9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GFI1BQ5VTD9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GFI1BQ5VTD9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GFI1BQ5VTD9 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GFI1BQ5VTD9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GFI1BQ5VTD9 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GFI1BQ5VTD9 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GFI1BQ5VTD9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GFI1BQ5VTD9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GFI1BQ5VTD9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GFI1BQ5VTD9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GFI1BQ5VTD9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GFI1BQ5VTD9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GFI1BQ5VTD9 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GFI1BQ5VTD9 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GFI1BQ5VTD9 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GFI1BQ5VTD9 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GFI1BQ5VTD9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GFI1BQ5VTD9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GFI1BQ5VTD9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GFI1BQ5VTD9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GFI1BQ5VTD9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GFI1BQ5VTD9 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GFI1BQ5VTD9 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GFI1BQ5VTD9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GFI1BQ5VTD9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GFI1BQ5VTD9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GFI1BQ5VTD9 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GFI1BQ5VTD9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GFI1BQ5VTD9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GFI1BQ5VTD9 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GFI1BQ5VTD9 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GFI1BQ5VTD9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GFI1BQ5VTD9 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GFI1BQ5VTD9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GFI1BQ5VTD9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GFI1BQ5VTD9 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GFI1BQ5VTD9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GFI1BQ5VTD9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GFI1BQ5VTD9 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GFI1BQ5VTD9 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GFI1BQ5VTD9 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GFI1BQ5VTD9 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GFI1BQ5VTD9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GFI1BQ5VTD9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GFI1BQ5VTD9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GFI1BQ5VTD9 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GFI1BQ5VTD9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GFI1BQ5VTD9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GFI1BQ5VTD9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GFI1BQ5VTD9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GFI1BQ5VTD9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GFI1BQ5VTD9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GFI1BQ5VTD9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GFI1BQ5VTD9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GFI1BQ5VTD9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms