Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PTPROQ16827 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PTPROQ16827 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.86■■■□□ 2.69
PTPROQ16827 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PTPROQ16827 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
PTPROQ16827 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PTPROQ16827 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PTPROQ16827 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PTPROQ16827 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
PTPROQ16827 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PTPROQ16827 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PTPROQ16827 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
PTPROQ16827 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
PTPROQ16827 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PTPROQ16827 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PTPROQ16827 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PTPROQ16827 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PTPROQ16827 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PTPROQ16827 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PTPROQ16827 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
PTPROQ16827 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PTPROQ16827 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PTPROQ16827 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PTPROQ16827 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PTPROQ16827 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PTPROQ16827 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PTPROQ16827 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PTPROQ16827 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PTPROQ16827 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PTPROQ16827 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PTPROQ16827 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
PTPROQ16827 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PTPROQ16827 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PTPROQ16827 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PTPROQ16827 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PTPROQ16827 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PTPROQ16827 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PTPROQ16827 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PTPROQ16827 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PTPROQ16827 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PTPROQ16827 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PTPROQ16827 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PTPROQ16827 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PTPROQ16827 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PTPROQ16827 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PTPROQ16827 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
PTPROQ16827 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PTPROQ16827 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
PTPROQ16827 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PTPROQ16827 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PTPROQ16827 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
PTPROQ16827 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTPROQ16827 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PTPROQ16827 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTPROQ16827 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PTPROQ16827 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PTPROQ16827 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PTPROQ16827 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
PTPROQ16827 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PTPROQ16827 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PTPROQ16827 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PTPROQ16827 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
PTPROQ16827 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PTPROQ16827 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PTPROQ16827 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
PTPROQ16827 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PTPROQ16827 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PTPROQ16827 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC31■■■□□ 2.55
PTPROQ16827 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PTPROQ16827 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PTPROQ16827 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PTPROQ16827 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
PTPROQ16827 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PTPROQ16827 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PTPROQ16827 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
PTPROQ16827 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PTPROQ16827 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PTPROQ16827 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PTPROQ16827 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PTPROQ16827 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PTPROQ16827 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PTPROQ16827 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PTPROQ16827 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
PTPROQ16827 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PTPROQ16827 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PTPROQ16827 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PTPROQ16827 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PTPROQ16827 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PTPROQ16827 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTPROQ16827 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPROQ16827 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPROQ16827 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPROQ16827 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PTPROQ16827 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PTPROQ16827 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PTPROQ16827 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PTPROQ16827 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PTPROQ16827 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PTPROQ16827 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PTPROQ16827 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
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