Protein–RNA interactions for Protein: Q16825

PTPN21, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 21, humanhuman

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN21Q16825 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
PTPN21Q16825 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PTPN21Q16825 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PTPN21Q16825 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
PTPN21Q16825 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
PTPN21Q16825 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
PTPN21Q16825 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PTPN21Q16825 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PTPN21Q16825 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PTPN21Q16825 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
PTPN21Q16825 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
PTPN21Q16825 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PTPN21Q16825 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PTPN21Q16825 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PTPN21Q16825 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
PTPN21Q16825 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PTPN21Q16825 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
PTPN21Q16825 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
PTPN21Q16825 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
PTPN21Q16825 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PTPN21Q16825 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
PTPN21Q16825 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC31.76■■■□□ 2.68
PTPN21Q16825 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PTPN21Q16825 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PTPN21Q16825 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PTPN21Q16825 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PTPN21Q16825 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
PTPN21Q16825 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PTPN21Q16825 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PTPN21Q16825 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PTPN21Q16825 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PTPN21Q16825 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
PTPN21Q16825 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.65
PTPN21Q16825 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PTPN21Q16825 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PTPN21Q16825 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PTPN21Q16825 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PTPN21Q16825 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PTPN21Q16825 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PTPN21Q16825 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PTPN21Q16825 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PTPN21Q16825 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PTPN21Q16825 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PTPN21Q16825 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PTPN21Q16825 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
PTPN21Q16825 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PTPN21Q16825 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PTPN21Q16825 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PTPN21Q16825 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPN21Q16825 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PTPN21Q16825 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PTPN21Q16825 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PTPN21Q16825 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PTPN21Q16825 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PTPN21Q16825 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PTPN21Q16825 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PTPN21Q16825 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
PTPN21Q16825 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PTPN21Q16825 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PTPN21Q16825 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PTPN21Q16825 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PTPN21Q16825 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PTPN21Q16825 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PTPN21Q16825 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
PTPN21Q16825 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC31.32■■■□□ 2.6
PTPN21Q16825 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
PTPN21Q16825 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
PTPN21Q16825 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
PTPN21Q16825 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PTPN21Q16825 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PTPN21Q16825 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PTPN21Q16825 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PTPN21Q16825 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PTPN21Q16825 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PTPN21Q16825 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTPN21Q16825 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTPN21Q16825 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PTPN21Q16825 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PTPN21Q16825 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PTPN21Q16825 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PTPN21Q16825 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PTPN21Q16825 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PTPN21Q16825 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
PTPN21Q16825 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PTPN21Q16825 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PTPN21Q16825 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PTPN21Q16825 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PTPN21Q16825 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PTPN21Q16825 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PTPN21Q16825 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PTPN21Q16825 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PTPN21Q16825 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
PTPN21Q16825 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PTPN21Q16825 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PTPN21Q16825 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PTPN21Q16825 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PTPN21Q16825 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PTPN21Q16825 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PTPN21Q16825 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PTPN21Q16825 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms