Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NRF1Q16656 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NRF1Q16656 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NRF1Q16656 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NRF1Q16656 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NRF1Q16656 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
NRF1Q16656 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NRF1Q16656 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NRF1Q16656 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NRF1Q16656 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NRF1Q16656 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NRF1Q16656 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NRF1Q16656 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NRF1Q16656 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NRF1Q16656 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NRF1Q16656 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NRF1Q16656 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NRF1Q16656 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NRF1Q16656 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NRF1Q16656 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NRF1Q16656 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NRF1Q16656 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NRF1Q16656 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NRF1Q16656 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NRF1Q16656 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NRF1Q16656 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NRF1Q16656 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NRF1Q16656 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NRF1Q16656 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NRF1Q16656 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NRF1Q16656 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NRF1Q16656 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NRF1Q16656 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NRF1Q16656 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NRF1Q16656 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NRF1Q16656 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NRF1Q16656 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NRF1Q16656 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NRF1Q16656 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NRF1Q16656 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NRF1Q16656 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NRF1Q16656 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NRF1Q16656 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NRF1Q16656 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NRF1Q16656 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NRF1Q16656 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NRF1Q16656 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NRF1Q16656 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NRF1Q16656 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NRF1Q16656 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NRF1Q16656 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NRF1Q16656 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NRF1Q16656 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NRF1Q16656 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NRF1Q16656 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NRF1Q16656 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NRF1Q16656 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NRF1Q16656 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NRF1Q16656 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NRF1Q16656 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NRF1Q16656 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
NRF1Q16656 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NRF1Q16656 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NRF1Q16656 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NRF1Q16656 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NRF1Q16656 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NRF1Q16656 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NRF1Q16656 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NRF1Q16656 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NRF1Q16656 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NRF1Q16656 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NRF1Q16656 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NRF1Q16656 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NRF1Q16656 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NRF1Q16656 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NRF1Q16656 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NRF1Q16656 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NRF1Q16656 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NRF1Q16656 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NRF1Q16656 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NRF1Q16656 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NRF1Q16656 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NRF1Q16656 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NRF1Q16656 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NRF1Q16656 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NRF1Q16656 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NRF1Q16656 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NRF1Q16656 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NRF1Q16656 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NRF1Q16656 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NRF1Q16656 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NRF1Q16656 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NRF1Q16656 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NRF1Q16656 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NRF1Q16656 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NRF1Q16656 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NRF1Q16656 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NRF1Q16656 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NRF1Q16656 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NRF1Q16656 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
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