Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TLR1Q15399 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TLR1Q15399 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TLR1Q15399 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TLR1Q15399 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TLR1Q15399 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TLR1Q15399 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TLR1Q15399 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TLR1Q15399 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TLR1Q15399 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TLR1Q15399 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TLR1Q15399 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TLR1Q15399 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TLR1Q15399 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
TLR1Q15399 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.04
TLR1Q15399 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TLR1Q15399 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TLR1Q15399 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TLR1Q15399 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TLR1Q15399 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TLR1Q15399 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TLR1Q15399 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TLR1Q15399 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TLR1Q15399 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TLR1Q15399 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TLR1Q15399 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TLR1Q15399 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TLR1Q15399 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TLR1Q15399 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TLR1Q15399 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TLR1Q15399 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TLR1Q15399 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TLR1Q15399 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TLR1Q15399 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TLR1Q15399 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TLR1Q15399 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TLR1Q15399 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TLR1Q15399 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TLR1Q15399 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TLR1Q15399 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TLR1Q15399 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TLR1Q15399 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TLR1Q15399 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TLR1Q15399 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TLR1Q15399 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TLR1Q15399 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TLR1Q15399 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TLR1Q15399 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TLR1Q15399 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TLR1Q15399 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TLR1Q15399 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TLR1Q15399 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TLR1Q15399 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TLR1Q15399 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TLR1Q15399 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TLR1Q15399 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TLR1Q15399 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TLR1Q15399 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TLR1Q15399 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TLR1Q15399 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TLR1Q15399 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TLR1Q15399 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TLR1Q15399 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TLR1Q15399 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TLR1Q15399 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TLR1Q15399 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TLR1Q15399 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TLR1Q15399 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TLR1Q15399 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TLR1Q15399 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TLR1Q15399 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TLR1Q15399 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TLR1Q15399 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TLR1Q15399 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TLR1Q15399 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TLR1Q15399 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TLR1Q15399 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TLR1Q15399 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TLR1Q15399 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TLR1Q15399 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TLR1Q15399 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TLR1Q15399 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TLR1Q15399 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TLR1Q15399 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TLR1Q15399 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TLR1Q15399 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TLR1Q15399 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TLR1Q15399 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TLR1Q15399 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TLR1Q15399 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TLR1Q15399 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TLR1Q15399 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TLR1Q15399 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TLR1Q15399 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TLR1Q15399 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TLR1Q15399 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TLR1Q15399 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TLR1Q15399 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TLR1Q15399 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TLR1Q15399 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms