Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDK3Q15120 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDK3Q15120 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDK3Q15120 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDK3Q15120 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDK3Q15120 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDK3Q15120 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDK3Q15120 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDK3Q15120 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDK3Q15120 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDK3Q15120 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDK3Q15120 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDK3Q15120 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDK3Q15120 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDK3Q15120 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDK3Q15120 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
PDK3Q15120 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDK3Q15120 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDK3Q15120 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDK3Q15120 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDK3Q15120 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDK3Q15120 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDK3Q15120 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDK3Q15120 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDK3Q15120 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PDK3Q15120 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDK3Q15120 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDK3Q15120 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDK3Q15120 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDK3Q15120 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDK3Q15120 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDK3Q15120 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDK3Q15120 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDK3Q15120 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDK3Q15120 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDK3Q15120 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDK3Q15120 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDK3Q15120 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDK3Q15120 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDK3Q15120 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDK3Q15120 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDK3Q15120 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDK3Q15120 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDK3Q15120 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDK3Q15120 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDK3Q15120 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDK3Q15120 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDK3Q15120 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDK3Q15120 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDK3Q15120 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDK3Q15120 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDK3Q15120 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDK3Q15120 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDK3Q15120 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDK3Q15120 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDK3Q15120 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDK3Q15120 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDK3Q15120 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PDK3Q15120 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDK3Q15120 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDK3Q15120 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDK3Q15120 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDK3Q15120 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDK3Q15120 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDK3Q15120 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDK3Q15120 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDK3Q15120 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDK3Q15120 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PDK3Q15120 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDK3Q15120 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDK3Q15120 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDK3Q15120 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDK3Q15120 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PDK3Q15120 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDK3Q15120 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDK3Q15120 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDK3Q15120 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDK3Q15120 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDK3Q15120 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDK3Q15120 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDK3Q15120 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDK3Q15120 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDK3Q15120 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDK3Q15120 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDK3Q15120 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDK3Q15120 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDK3Q15120 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PDK3Q15120 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDK3Q15120 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDK3Q15120 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDK3Q15120 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDK3Q15120 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDK3Q15120 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDK3Q15120 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDK3Q15120 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PDK3Q15120 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PDK3Q15120 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDK3Q15120 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDK3Q15120 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDK3Q15120 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
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