Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.38■■■□□ 2.77
PDK3Q15120 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
PDK3Q15120 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PDK3Q15120 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PDK3Q15120 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PDK3Q15120 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PDK3Q15120 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PDK3Q15120 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PDK3Q15120 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
PDK3Q15120 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PDK3Q15120 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PDK3Q15120 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PDK3Q15120 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PDK3Q15120 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PDK3Q15120 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PDK3Q15120 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PDK3Q15120 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PDK3Q15120 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PDK3Q15120 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
PDK3Q15120 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PDK3Q15120 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PDK3Q15120 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PDK3Q15120 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PDK3Q15120 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PDK3Q15120 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PDK3Q15120 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PDK3Q15120 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PDK3Q15120 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PDK3Q15120 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PDK3Q15120 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PDK3Q15120 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PDK3Q15120 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PDK3Q15120 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDK3Q15120 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PDK3Q15120 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PDK3Q15120 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PDK3Q15120 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PDK3Q15120 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PDK3Q15120 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PDK3Q15120 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDK3Q15120 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDK3Q15120 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDK3Q15120 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDK3Q15120 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PDK3Q15120 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PDK3Q15120 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PDK3Q15120 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PDK3Q15120 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PDK3Q15120 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDK3Q15120 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDK3Q15120 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDK3Q15120 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDK3Q15120 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PDK3Q15120 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDK3Q15120 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDK3Q15120 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDK3Q15120 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PDK3Q15120 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PDK3Q15120 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDK3Q15120 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDK3Q15120 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PDK3Q15120 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PDK3Q15120 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PDK3Q15120 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PDK3Q15120 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDK3Q15120 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDK3Q15120 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDK3Q15120 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDK3Q15120 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDK3Q15120 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDK3Q15120 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDK3Q15120 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PDK3Q15120 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDK3Q15120 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDK3Q15120 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDK3Q15120 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDK3Q15120 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDK3Q15120 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDK3Q15120 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDK3Q15120 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDK3Q15120 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDK3Q15120 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDK3Q15120 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDK3Q15120 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDK3Q15120 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDK3Q15120 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDK3Q15120 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDK3Q15120 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDK3Q15120 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDK3Q15120 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDK3Q15120 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDK3Q15120 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDK3Q15120 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDK3Q15120 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDK3Q15120 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PDK3Q15120 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PDK3Q15120 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PDK3Q15120 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PDK3Q15120 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDK3Q15120 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
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