Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAB39AQ14964 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAB39AQ14964 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAB39AQ14964 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB39AQ14964 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAB39AQ14964 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAB39AQ14964 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAB39AQ14964 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAB39AQ14964 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAB39AQ14964 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAB39AQ14964 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAB39AQ14964 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAB39AQ14964 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAB39AQ14964 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAB39AQ14964 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAB39AQ14964 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAB39AQ14964 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAB39AQ14964 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAB39AQ14964 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAB39AQ14964 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAB39AQ14964 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAB39AQ14964 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAB39AQ14964 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAB39AQ14964 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAB39AQ14964 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAB39AQ14964 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAB39AQ14964 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAB39AQ14964 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAB39AQ14964 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RAB39AQ14964 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RAB39AQ14964 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RAB39AQ14964 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAB39AQ14964 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAB39AQ14964 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAB39AQ14964 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAB39AQ14964 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAB39AQ14964 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAB39AQ14964 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAB39AQ14964 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAB39AQ14964 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAB39AQ14964 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAB39AQ14964 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAB39AQ14964 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAB39AQ14964 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAB39AQ14964 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAB39AQ14964 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAB39AQ14964 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAB39AQ14964 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAB39AQ14964 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAB39AQ14964 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAB39AQ14964 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAB39AQ14964 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RAB39AQ14964 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAB39AQ14964 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB39AQ14964 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB39AQ14964 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB39AQ14964 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB39AQ14964 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB39AQ14964 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAB39AQ14964 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAB39AQ14964 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAB39AQ14964 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAB39AQ14964 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB39AQ14964 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAB39AQ14964 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB39AQ14964 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB39AQ14964 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB39AQ14964 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAB39AQ14964 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB39AQ14964 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAB39AQ14964 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAB39AQ14964 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAB39AQ14964 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAB39AQ14964 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAB39AQ14964 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB39AQ14964 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RAB39AQ14964 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAB39AQ14964 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RAB39AQ14964 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB39AQ14964 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB39AQ14964 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB39AQ14964 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAB39AQ14964 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAB39AQ14964 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB39AQ14964 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB39AQ14964 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB39AQ14964 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB39AQ14964 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB39AQ14964 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB39AQ14964 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB39AQ14964 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB39AQ14964 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB39AQ14964 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB39AQ14964 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB39AQ14964 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB39AQ14964 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB39AQ14964 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB39AQ14964 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB39AQ14964 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB39AQ14964 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
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