Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MDC1Q14676 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
MDC1Q14676 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MDC1Q14676 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MDC1Q14676 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MDC1Q14676 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MDC1Q14676 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MDC1Q14676 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MDC1Q14676 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MDC1Q14676 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MDC1Q14676 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
MDC1Q14676 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MDC1Q14676 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MDC1Q14676 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MDC1Q14676 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
MDC1Q14676 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MDC1Q14676 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MDC1Q14676 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MDC1Q14676 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MDC1Q14676 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MDC1Q14676 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MDC1Q14676 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MDC1Q14676 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MDC1Q14676 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MDC1Q14676 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MDC1Q14676 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
MDC1Q14676 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MDC1Q14676 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MDC1Q14676 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MDC1Q14676 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MDC1Q14676 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MDC1Q14676 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
MDC1Q14676 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MDC1Q14676 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MDC1Q14676 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MDC1Q14676 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MDC1Q14676 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MDC1Q14676 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MDC1Q14676 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MDC1Q14676 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MDC1Q14676 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MDC1Q14676 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MDC1Q14676 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MDC1Q14676 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MDC1Q14676 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MDC1Q14676 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MDC1Q14676 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MDC1Q14676 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MDC1Q14676 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MDC1Q14676 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MDC1Q14676 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MDC1Q14676 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MDC1Q14676 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MDC1Q14676 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MDC1Q14676 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MDC1Q14676 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MDC1Q14676 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MDC1Q14676 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
MDC1Q14676 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MDC1Q14676 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MDC1Q14676 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MDC1Q14676 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MDC1Q14676 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MDC1Q14676 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MDC1Q14676 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MDC1Q14676 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MDC1Q14676 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MDC1Q14676 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MDC1Q14676 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MDC1Q14676 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MDC1Q14676 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MDC1Q14676 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MDC1Q14676 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MDC1Q14676 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MDC1Q14676 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MDC1Q14676 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MDC1Q14676 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MDC1Q14676 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MDC1Q14676 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MDC1Q14676 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MDC1Q14676 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MDC1Q14676 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MDC1Q14676 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MDC1Q14676 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MDC1Q14676 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MDC1Q14676 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MDC1Q14676 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MDC1Q14676 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MDC1Q14676 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MDC1Q14676 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MDC1Q14676 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MDC1Q14676 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MDC1Q14676 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MDC1Q14676 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MDC1Q14676 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MDC1Q14676 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MDC1Q14676 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MDC1Q14676 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MDC1Q14676 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MDC1Q14676 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
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