Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
COL9A2Q14055 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
COL9A2Q14055 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
COL9A2Q14055 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
COL9A2Q14055 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
COL9A2Q14055 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
COL9A2Q14055 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
COL9A2Q14055 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
COL9A2Q14055 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
COL9A2Q14055 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
COL9A2Q14055 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
COL9A2Q14055 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
COL9A2Q14055 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
COL9A2Q14055 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
COL9A2Q14055 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
COL9A2Q14055 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
COL9A2Q14055 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
COL9A2Q14055 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
COL9A2Q14055 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
COL9A2Q14055 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL9A2Q14055 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL9A2Q14055 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL9A2Q14055 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
COL9A2Q14055 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
COL9A2Q14055 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
COL9A2Q14055 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
COL9A2Q14055 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
COL9A2Q14055 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
COL9A2Q14055 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
COL9A2Q14055 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
COL9A2Q14055 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
COL9A2Q14055 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
COL9A2Q14055 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
COL9A2Q14055 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
COL9A2Q14055 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
COL9A2Q14055 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
COL9A2Q14055 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
COL9A2Q14055 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
COL9A2Q14055 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
COL9A2Q14055 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
COL9A2Q14055 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
COL9A2Q14055 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
COL9A2Q14055 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
COL9A2Q14055 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
COL9A2Q14055 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
COL9A2Q14055 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
COL9A2Q14055 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
COL9A2Q14055 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL9A2Q14055 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
COL9A2Q14055 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL9A2Q14055 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
COL9A2Q14055 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
COL9A2Q14055 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
COL9A2Q14055 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
COL9A2Q14055 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
COL9A2Q14055 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
COL9A2Q14055 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
COL9A2Q14055 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL9A2Q14055 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL9A2Q14055 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL9A2Q14055 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL9A2Q14055 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
COL9A2Q14055 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL9A2Q14055 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
COL9A2Q14055 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
COL9A2Q14055 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
COL9A2Q14055 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
COL9A2Q14055 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL9A2Q14055 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
COL9A2Q14055 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
COL9A2Q14055 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
COL9A2Q14055 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
COL9A2Q14055 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
COL9A2Q14055 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
COL9A2Q14055 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
COL9A2Q14055 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
COL9A2Q14055 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
COL9A2Q14055 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
COL9A2Q14055 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
COL9A2Q14055 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
COL9A2Q14055 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
COL9A2Q14055 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
COL9A2Q14055 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
COL9A2Q14055 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
COL9A2Q14055 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
COL9A2Q14055 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
COL9A2Q14055 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
COL9A2Q14055 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
COL9A2Q14055 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
COL9A2Q14055 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
COL9A2Q14055 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
COL9A2Q14055 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
COL9A2Q14055 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
COL9A2Q14055 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
COL9A2Q14055 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
COL9A2Q14055 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
COL9A2Q14055 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
COL9A2Q14055 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
COL9A2Q14055 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL9A2Q14055 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 428.7 ms