Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TUBA3CQ13748 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TUBA3CQ13748 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TUBA3CQ13748 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TUBA3CQ13748 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TUBA3CQ13748 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TUBA3CQ13748 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TUBA3CQ13748 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TUBA3CQ13748 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TUBA3CQ13748 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TUBA3CQ13748 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TUBA3CQ13748 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TUBA3CQ13748 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TUBA3CQ13748 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TUBA3CQ13748 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TUBA3CQ13748 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TUBA3CQ13748 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TUBA3CQ13748 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TUBA3CQ13748 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUBA3CQ13748 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUBA3CQ13748 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TUBA3CQ13748 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TUBA3CQ13748 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TUBA3CQ13748 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TUBA3CQ13748 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TUBA3CQ13748 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TUBA3CQ13748 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TUBA3CQ13748 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TUBA3CQ13748 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TUBA3CQ13748 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TUBA3CQ13748 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TUBA3CQ13748 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TUBA3CQ13748 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TUBA3CQ13748 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TUBA3CQ13748 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TUBA3CQ13748 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TUBA3CQ13748 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TUBA3CQ13748 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TUBA3CQ13748 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TUBA3CQ13748 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TUBA3CQ13748 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TUBA3CQ13748 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TUBA3CQ13748 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TUBA3CQ13748 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TUBA3CQ13748 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TUBA3CQ13748 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TUBA3CQ13748 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TUBA3CQ13748 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TUBA3CQ13748 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TUBA3CQ13748 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TUBA3CQ13748 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TUBA3CQ13748 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TUBA3CQ13748 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TUBA3CQ13748 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TUBA3CQ13748 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TUBA3CQ13748 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TUBA3CQ13748 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TUBA3CQ13748 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TUBA3CQ13748 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TUBA3CQ13748 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TUBA3CQ13748 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TUBA3CQ13748 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TUBA3CQ13748 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TUBA3CQ13748 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TUBA3CQ13748 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TUBA3CQ13748 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TUBA3CQ13748 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TUBA3CQ13748 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TUBA3CQ13748 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TUBA3CQ13748 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TUBA3CQ13748 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TUBA3CQ13748 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TUBA3CQ13748 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TUBA3CQ13748 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TUBA3CQ13748 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TUBA3CQ13748 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TUBA3CQ13748 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TUBA3CQ13748 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TUBA3CQ13748 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TUBA3CQ13748 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TUBA3CQ13748 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TUBA3CQ13748 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TUBA3CQ13748 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TUBA3CQ13748 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TUBA3CQ13748 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TUBA3CQ13748 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TUBA3CQ13748 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TUBA3CQ13748 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TUBA3CQ13748 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TUBA3CQ13748 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TUBA3CQ13748 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TUBA3CQ13748 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TUBA3CQ13748 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TUBA3CQ13748 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TUBA3CQ13748 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TUBA3CQ13748 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TUBA3CQ13748 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TUBA3CQ13748 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TUBA3CQ13748 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TUBA3CQ13748 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
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