Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Length 168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PMS2P3Q13401 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PMS2P3Q13401 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PMS2P3Q13401 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PMS2P3Q13401 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PMS2P3Q13401 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PMS2P3Q13401 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PMS2P3Q13401 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PMS2P3Q13401 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PMS2P3Q13401 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PMS2P3Q13401 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PMS2P3Q13401 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PMS2P3Q13401 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PMS2P3Q13401 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PMS2P3Q13401 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PMS2P3Q13401 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PMS2P3Q13401 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PMS2P3Q13401 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PMS2P3Q13401 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PMS2P3Q13401 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PMS2P3Q13401 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PMS2P3Q13401 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PMS2P3Q13401 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PMS2P3Q13401 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PMS2P3Q13401 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PMS2P3Q13401 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PMS2P3Q13401 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PMS2P3Q13401 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PMS2P3Q13401 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PMS2P3Q13401 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PMS2P3Q13401 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PMS2P3Q13401 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PMS2P3Q13401 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PMS2P3Q13401 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PMS2P3Q13401 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PMS2P3Q13401 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PMS2P3Q13401 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PMS2P3Q13401 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PMS2P3Q13401 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PMS2P3Q13401 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PMS2P3Q13401 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PMS2P3Q13401 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PMS2P3Q13401 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PMS2P3Q13401 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PMS2P3Q13401 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PMS2P3Q13401 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PMS2P3Q13401 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PMS2P3Q13401 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PMS2P3Q13401 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PMS2P3Q13401 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PMS2P3Q13401 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PMS2P3Q13401 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PMS2P3Q13401 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PMS2P3Q13401 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PMS2P3Q13401 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PMS2P3Q13401 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PMS2P3Q13401 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PMS2P3Q13401 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PMS2P3Q13401 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PMS2P3Q13401 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PMS2P3Q13401 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PMS2P3Q13401 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PMS2P3Q13401 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PMS2P3Q13401 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PMS2P3Q13401 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PMS2P3Q13401 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PMS2P3Q13401 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PMS2P3Q13401 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PMS2P3Q13401 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PMS2P3Q13401 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PMS2P3Q13401 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PMS2P3Q13401 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PMS2P3Q13401 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PMS2P3Q13401 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PMS2P3Q13401 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PMS2P3Q13401 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PMS2P3Q13401 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PMS2P3Q13401 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PMS2P3Q13401 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PMS2P3Q13401 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PMS2P3Q13401 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PMS2P3Q13401 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PMS2P3Q13401 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PMS2P3Q13401 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PMS2P3Q13401 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PMS2P3Q13401 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PMS2P3Q13401 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PMS2P3Q13401 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PMS2P3Q13401 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PMS2P3Q13401 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PMS2P3Q13401 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PMS2P3Q13401 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PMS2P3Q13401 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PMS2P3Q13401 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PMS2P3Q13401 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PMS2P3Q13401 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PMS2P3Q13401 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PMS2P3Q13401 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PMS2P3Q13401 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PMS2P3Q13401 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
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