Protein–RNA interactions for Protein: Q13349

ITGAD, Integrin alpha-D, humanhuman

Predictions only

Length 1,161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGADQ13349 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGADQ13349 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGADQ13349 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGADQ13349 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGADQ13349 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGADQ13349 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGADQ13349 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGADQ13349 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGADQ13349 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITGADQ13349 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITGADQ13349 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGADQ13349 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGADQ13349 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ITGADQ13349 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ITGADQ13349 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGADQ13349 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGADQ13349 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGADQ13349 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGADQ13349 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGADQ13349 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGADQ13349 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGADQ13349 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGADQ13349 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGADQ13349 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGADQ13349 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGADQ13349 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGADQ13349 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGADQ13349 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ITGADQ13349 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGADQ13349 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGADQ13349 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGADQ13349 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGADQ13349 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITGADQ13349 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGADQ13349 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGADQ13349 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGADQ13349 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGADQ13349 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGADQ13349 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGADQ13349 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGADQ13349 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGADQ13349 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGADQ13349 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGADQ13349 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGADQ13349 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGADQ13349 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGADQ13349 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGADQ13349 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGADQ13349 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ITGADQ13349 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGADQ13349 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGADQ13349 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGADQ13349 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ITGADQ13349 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ITGADQ13349 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGADQ13349 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGADQ13349 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGADQ13349 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGADQ13349 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGADQ13349 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGADQ13349 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGADQ13349 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ITGADQ13349 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ITGADQ13349 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGADQ13349 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGADQ13349 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGADQ13349 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGADQ13349 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGADQ13349 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGADQ13349 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGADQ13349 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGADQ13349 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGADQ13349 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGADQ13349 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGADQ13349 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGADQ13349 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGADQ13349 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
ITGADQ13349 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
ITGADQ13349 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGADQ13349 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGADQ13349 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGADQ13349 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGADQ13349 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGADQ13349 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGADQ13349 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGADQ13349 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGADQ13349 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGADQ13349 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGADQ13349 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGADQ13349 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGADQ13349 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGADQ13349 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGADQ13349 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGADQ13349 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGADQ13349 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGADQ13349 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGADQ13349 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGADQ13349 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGADQ13349 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGADQ13349 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms