Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
IFT88Q13099 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
IFT88Q13099 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
IFT88Q13099 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
IFT88Q13099 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
IFT88Q13099 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
IFT88Q13099 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
IFT88Q13099 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
IFT88Q13099 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
IFT88Q13099 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
IFT88Q13099 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
IFT88Q13099 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
IFT88Q13099 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
IFT88Q13099 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
IFT88Q13099 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
IFT88Q13099 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
IFT88Q13099 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
IFT88Q13099 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
IFT88Q13099 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
IFT88Q13099 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
IFT88Q13099 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
IFT88Q13099 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
IFT88Q13099 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
IFT88Q13099 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
IFT88Q13099 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
IFT88Q13099 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
IFT88Q13099 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
IFT88Q13099 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
IFT88Q13099 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
IFT88Q13099 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
IFT88Q13099 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
IFT88Q13099 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
IFT88Q13099 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
IFT88Q13099 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
IFT88Q13099 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
IFT88Q13099 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
IFT88Q13099 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
IFT88Q13099 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
IFT88Q13099 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
IFT88Q13099 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
IFT88Q13099 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
IFT88Q13099 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
IFT88Q13099 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
IFT88Q13099 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
IFT88Q13099 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
IFT88Q13099 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
IFT88Q13099 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
IFT88Q13099 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
IFT88Q13099 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
IFT88Q13099 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
IFT88Q13099 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
IFT88Q13099 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
IFT88Q13099 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
IFT88Q13099 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
IFT88Q13099 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
IFT88Q13099 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
IFT88Q13099 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
IFT88Q13099 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
IFT88Q13099 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
IFT88Q13099 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
IFT88Q13099 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
IFT88Q13099 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
IFT88Q13099 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
IFT88Q13099 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
IFT88Q13099 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
IFT88Q13099 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
IFT88Q13099 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
IFT88Q13099 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
IFT88Q13099 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
IFT88Q13099 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
IFT88Q13099 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
IFT88Q13099 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
IFT88Q13099 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
IFT88Q13099 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
IFT88Q13099 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
IFT88Q13099 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
IFT88Q13099 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
IFT88Q13099 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IFT88Q13099 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IFT88Q13099 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
IFT88Q13099 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
IFT88Q13099 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
IFT88Q13099 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
IFT88Q13099 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
IFT88Q13099 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IFT88Q13099 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IFT88Q13099 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
IFT88Q13099 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
IFT88Q13099 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
IFT88Q13099 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
IFT88Q13099 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
IFT88Q13099 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
IFT88Q13099 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
IFT88Q13099 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IFT88Q13099 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IFT88Q13099 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IFT88Q13099 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IFT88Q13099 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IFT88Q13099 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
IFT88Q13099 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
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