Protein–RNA interactions for Protein: Q02575

NHLH1, Helix-loop-helix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH1Q02575 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NHLH1Q02575 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NHLH1Q02575 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
NHLH1Q02575 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NHLH1Q02575 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NHLH1Q02575 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NHLH1Q02575 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NHLH1Q02575 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NHLH1Q02575 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NHLH1Q02575 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
NHLH1Q02575 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NHLH1Q02575 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NHLH1Q02575 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NHLH1Q02575 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NHLH1Q02575 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
NHLH1Q02575 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NHLH1Q02575 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NHLH1Q02575 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NHLH1Q02575 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NHLH1Q02575 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NHLH1Q02575 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NHLH1Q02575 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NHLH1Q02575 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
NHLH1Q02575 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NHLH1Q02575 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NHLH1Q02575 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NHLH1Q02575 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NHLH1Q02575 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NHLH1Q02575 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NHLH1Q02575 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NHLH1Q02575 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
NHLH1Q02575 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NHLH1Q02575 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NHLH1Q02575 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
NHLH1Q02575 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NHLH1Q02575 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NHLH1Q02575 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NHLH1Q02575 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NHLH1Q02575 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
NHLH1Q02575 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NHLH1Q02575 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
NHLH1Q02575 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NHLH1Q02575 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NHLH1Q02575 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NHLH1Q02575 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NHLH1Q02575 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NHLH1Q02575 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NHLH1Q02575 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
NHLH1Q02575 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NHLH1Q02575 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NHLH1Q02575 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NHLH1Q02575 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NHLH1Q02575 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NHLH1Q02575 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NHLH1Q02575 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NHLH1Q02575 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NHLH1Q02575 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NHLH1Q02575 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NHLH1Q02575 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NHLH1Q02575 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NHLH1Q02575 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NHLH1Q02575 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NHLH1Q02575 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NHLH1Q02575 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NHLH1Q02575 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NHLH1Q02575 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
NHLH1Q02575 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NHLH1Q02575 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NHLH1Q02575 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NHLH1Q02575 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NHLH1Q02575 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NHLH1Q02575 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NHLH1Q02575 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NHLH1Q02575 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NHLH1Q02575 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NHLH1Q02575 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NHLH1Q02575 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
NHLH1Q02575 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NHLH1Q02575 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NHLH1Q02575 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NHLH1Q02575 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NHLH1Q02575 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NHLH1Q02575 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NHLH1Q02575 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
NHLH1Q02575 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NHLH1Q02575 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NHLH1Q02575 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NHLH1Q02575 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
NHLH1Q02575 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NHLH1Q02575 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NHLH1Q02575 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NHLH1Q02575 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NHLH1Q02575 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NHLH1Q02575 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NHLH1Q02575 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NHLH1Q02575 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NHLH1Q02575 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
NHLH1Q02575 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NHLH1Q02575 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NHLH1Q02575 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms