Protein–RNA interactions for Protein: P78413

IRX4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX4P78413 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
IRX4P78413 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
IRX4P78413 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
IRX4P78413 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
IRX4P78413 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
IRX4P78413 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
IRX4P78413 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
IRX4P78413 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
IRX4P78413 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
IRX4P78413 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
IRX4P78413 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
IRX4P78413 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
IRX4P78413 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
IRX4P78413 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
IRX4P78413 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
IRX4P78413 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
IRX4P78413 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
IRX4P78413 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
IRX4P78413 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
IRX4P78413 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
IRX4P78413 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
IRX4P78413 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
IRX4P78413 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
IRX4P78413 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
IRX4P78413 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
IRX4P78413 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
IRX4P78413 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
IRX4P78413 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
IRX4P78413 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
IRX4P78413 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
IRX4P78413 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
IRX4P78413 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
IRX4P78413 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
IRX4P78413 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
IRX4P78413 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
IRX4P78413 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
IRX4P78413 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
IRX4P78413 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
IRX4P78413 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
IRX4P78413 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
IRX4P78413 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
IRX4P78413 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
IRX4P78413 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
IRX4P78413 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
IRX4P78413 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
IRX4P78413 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
IRX4P78413 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
IRX4P78413 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
IRX4P78413 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
IRX4P78413 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
IRX4P78413 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
IRX4P78413 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
IRX4P78413 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
IRX4P78413 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
IRX4P78413 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
IRX4P78413 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
IRX4P78413 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
IRX4P78413 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
IRX4P78413 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
IRX4P78413 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
IRX4P78413 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
IRX4P78413 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
IRX4P78413 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
IRX4P78413 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
IRX4P78413 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
IRX4P78413 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
IRX4P78413 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
IRX4P78413 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
IRX4P78413 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
IRX4P78413 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
IRX4P78413 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
IRX4P78413 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
IRX4P78413 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
IRX4P78413 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
IRX4P78413 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
IRX4P78413 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
IRX4P78413 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
IRX4P78413 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
IRX4P78413 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
IRX4P78413 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
IRX4P78413 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
IRX4P78413 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
IRX4P78413 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
IRX4P78413 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
IRX4P78413 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
IRX4P78413 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
IRX4P78413 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
IRX4P78413 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
IRX4P78413 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
IRX4P78413 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
IRX4P78413 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
IRX4P78413 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
IRX4P78413 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
IRX4P78413 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
IRX4P78413 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
IRX4P78413 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
IRX4P78413 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
IRX4P78413 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
IRX4P78413 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
IRX4P78413 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms