Protein–RNA interactions for Protein: P78396

CCNA1, Cyclin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA1P78396 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CCNA1P78396 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CCNA1P78396 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CCNA1P78396 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CCNA1P78396 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CCNA1P78396 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CCNA1P78396 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CCNA1P78396 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CCNA1P78396 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CCNA1P78396 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CCNA1P78396 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CCNA1P78396 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CCNA1P78396 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CCNA1P78396 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CCNA1P78396 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
CCNA1P78396 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CCNA1P78396 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CCNA1P78396 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CCNA1P78396 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CCNA1P78396 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CCNA1P78396 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CCNA1P78396 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CCNA1P78396 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CCNA1P78396 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CCNA1P78396 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CCNA1P78396 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CCNA1P78396 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CCNA1P78396 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CCNA1P78396 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CCNA1P78396 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CCNA1P78396 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CCNA1P78396 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CCNA1P78396 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CCNA1P78396 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CCNA1P78396 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CCNA1P78396 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CCNA1P78396 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CCNA1P78396 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
CCNA1P78396 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CCNA1P78396 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
CCNA1P78396 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CCNA1P78396 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CCNA1P78396 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CCNA1P78396 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CCNA1P78396 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CCNA1P78396 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CCNA1P78396 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
CCNA1P78396 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CCNA1P78396 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
CCNA1P78396 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CCNA1P78396 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CCNA1P78396 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CCNA1P78396 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CCNA1P78396 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CCNA1P78396 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CCNA1P78396 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
CCNA1P78396 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CCNA1P78396 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CCNA1P78396 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CCNA1P78396 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CCNA1P78396 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CCNA1P78396 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CCNA1P78396 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CCNA1P78396 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CCNA1P78396 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CCNA1P78396 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
CCNA1P78396 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CCNA1P78396 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CCNA1P78396 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CCNA1P78396 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CCNA1P78396 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
CCNA1P78396 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CCNA1P78396 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CCNA1P78396 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CCNA1P78396 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
CCNA1P78396 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CCNA1P78396 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CCNA1P78396 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CCNA1P78396 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CCNA1P78396 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CCNA1P78396 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CCNA1P78396 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CCNA1P78396 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CCNA1P78396 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CCNA1P78396 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CCNA1P78396 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
CCNA1P78396 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
CCNA1P78396 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CCNA1P78396 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CCNA1P78396 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CCNA1P78396 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CCNA1P78396 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
CCNA1P78396 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
CCNA1P78396 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CCNA1P78396 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CCNA1P78396 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
CCNA1P78396 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CCNA1P78396 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
CCNA1P78396 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CCNA1P78396 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms