Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
TUBB4BP68371 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
TUBB4BP68371 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
TUBB4BP68371 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
TUBB4BP68371 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TUBB4BP68371 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TUBB4BP68371 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
TUBB4BP68371 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TUBB4BP68371 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TUBB4BP68371 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.49
TUBB4BP68371 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TUBB4BP68371 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
TUBB4BP68371 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TUBB4BP68371 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
TUBB4BP68371 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TUBB4BP68371 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TUBB4BP68371 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TUBB4BP68371 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
TUBB4BP68371 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
TUBB4BP68371 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TUBB4BP68371 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TUBB4BP68371 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TUBB4BP68371 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
TUBB4BP68371 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TUBB4BP68371 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TUBB4BP68371 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TUBB4BP68371 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
TUBB4BP68371 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TUBB4BP68371 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.45
TUBB4BP68371 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
TUBB4BP68371 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TUBB4BP68371 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TUBB4BP68371 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
TUBB4BP68371 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TUBB4BP68371 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
TUBB4BP68371 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TUBB4BP68371 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TUBB4BP68371 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TUBB4BP68371 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TUBB4BP68371 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
TUBB4BP68371 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
TUBB4BP68371 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TUBB4BP68371 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TUBB4BP68371 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TUBB4BP68371 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TUBB4BP68371 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TUBB4BP68371 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TUBB4BP68371 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TUBB4BP68371 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TUBB4BP68371 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TUBB4BP68371 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TUBB4BP68371 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TUBB4BP68371 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TUBB4BP68371 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TUBB4BP68371 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TUBB4BP68371 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TUBB4BP68371 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TUBB4BP68371 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TUBB4BP68371 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TUBB4BP68371 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TUBB4BP68371 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TUBB4BP68371 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TUBB4BP68371 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TUBB4BP68371 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TUBB4BP68371 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TUBB4BP68371 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TUBB4BP68371 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TUBB4BP68371 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TUBB4BP68371 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TUBB4BP68371 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TUBB4BP68371 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TUBB4BP68371 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TUBB4BP68371 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TUBB4BP68371 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TUBB4BP68371 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TUBB4BP68371 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TUBB4BP68371 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TUBB4BP68371 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TUBB4BP68371 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TUBB4BP68371 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TUBB4BP68371 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TUBB4BP68371 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TUBB4BP68371 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TUBB4BP68371 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TUBB4BP68371 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TUBB4BP68371 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TUBB4BP68371 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TUBB4BP68371 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TUBB4BP68371 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TUBB4BP68371 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TUBB4BP68371 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TUBB4BP68371 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TUBB4BP68371 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
TUBB4BP68371 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TUBB4BP68371 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TUBB4BP68371 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TUBB4BP68371 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TUBB4BP68371 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TUBB4BP68371 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TUBB4BP68371 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms