Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPS3AP61247 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RPS3AP61247 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RPS3AP61247 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RPS3AP61247 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RPS3AP61247 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RPS3AP61247 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RPS3AP61247 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RPS3AP61247 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RPS3AP61247 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RPS3AP61247 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RPS3AP61247 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RPS3AP61247 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RPS3AP61247 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RPS3AP61247 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RPS3AP61247 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RPS3AP61247 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPS3AP61247 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPS3AP61247 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RPS3AP61247 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPS3AP61247 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RPS3AP61247 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPS3AP61247 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RPS3AP61247 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RPS3AP61247 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RPS3AP61247 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RPS3AP61247 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RPS3AP61247 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RPS3AP61247 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RPS3AP61247 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RPS3AP61247 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RPS3AP61247 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RPS3AP61247 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RPS3AP61247 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RPS3AP61247 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RPS3AP61247 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RPS3AP61247 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RPS3AP61247 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RPS3AP61247 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RPS3AP61247 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RPS3AP61247 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RPS3AP61247 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RPS3AP61247 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RPS3AP61247 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RPS3AP61247 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPS3AP61247 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPS3AP61247 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPS3AP61247 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPS3AP61247 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPS3AP61247 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPS3AP61247 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RPS3AP61247 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
RPS3AP61247 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPS3AP61247 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPS3AP61247 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPS3AP61247 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPS3AP61247 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPS3AP61247 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPS3AP61247 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RPS3AP61247 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPS3AP61247 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPS3AP61247 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RPS3AP61247 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPS3AP61247 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPS3AP61247 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPS3AP61247 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPS3AP61247 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPS3AP61247 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPS3AP61247 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPS3AP61247 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPS3AP61247 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RPS3AP61247 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPS3AP61247 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RPS3AP61247 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPS3AP61247 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPS3AP61247 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPS3AP61247 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPS3AP61247 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPS3AP61247 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPS3AP61247 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPS3AP61247 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPS3AP61247 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPS3AP61247 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPS3AP61247 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RPS3AP61247 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPS3AP61247 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPS3AP61247 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPS3AP61247 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPS3AP61247 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPS3AP61247 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPS3AP61247 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPS3AP61247 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPS3AP61247 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPS3AP61247 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPS3AP61247 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPS3AP61247 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPS3AP61247 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPS3AP61247 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPS3AP61247 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPS3AP61247 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.4 ms