Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACTBP60709 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACTBP60709 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACTBP60709 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACTBP60709 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACTBP60709 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACTBP60709 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACTBP60709 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACTBP60709 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ACTBP60709 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACTBP60709 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACTBP60709 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACTBP60709 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACTBP60709 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACTBP60709 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACTBP60709 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACTBP60709 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACTBP60709 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACTBP60709 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACTBP60709 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACTBP60709 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACTBP60709 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACTBP60709 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACTBP60709 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACTBP60709 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACTBP60709 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ACTBP60709 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACTBP60709 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACTBP60709 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACTBP60709 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACTBP60709 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACTBP60709 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACTBP60709 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACTBP60709 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACTBP60709 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACTBP60709 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACTBP60709 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACTBP60709 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACTBP60709 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACTBP60709 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACTBP60709 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACTBP60709 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACTBP60709 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACTBP60709 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACTBP60709 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACTBP60709 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACTBP60709 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACTBP60709 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACTBP60709 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACTBP60709 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACTBP60709 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACTBP60709 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACTBP60709 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACTBP60709 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACTBP60709 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACTBP60709 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACTBP60709 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACTBP60709 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACTBP60709 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACTBP60709 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACTBP60709 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACTBP60709 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTBP60709 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACTBP60709 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACTBP60709 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACTBP60709 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACTBP60709 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACTBP60709 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACTBP60709 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACTBP60709 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACTBP60709 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACTBP60709 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACTBP60709 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACTBP60709 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACTBP60709 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACTBP60709 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACTBP60709 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACTBP60709 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACTBP60709 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACTBP60709 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACTBP60709 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACTBP60709 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACTBP60709 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACTBP60709 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTBP60709 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTBP60709 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACTBP60709 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACTBP60709 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACTBP60709 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACTBP60709 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTBP60709 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTBP60709 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTBP60709 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACTBP60709 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACTBP60709 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTBP60709 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTBP60709 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTBP60709 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTBP60709 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTBP60709 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms