Protein–RNA interactions for Protein: P60369

KRTAP10-3, Keratin-associated protein 10-3, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP10-3P60369 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRTAP10-3P60369 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRTAP10-3P60369 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRTAP10-3P60369 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRTAP10-3P60369 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRTAP10-3P60369 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRTAP10-3P60369 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRTAP10-3P60369 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRTAP10-3P60369 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRTAP10-3P60369 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRTAP10-3P60369 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRTAP10-3P60369 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRTAP10-3P60369 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRTAP10-3P60369 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRTAP10-3P60369 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRTAP10-3P60369 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRTAP10-3P60369 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRTAP10-3P60369 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRTAP10-3P60369 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRTAP10-3P60369 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRTAP10-3P60369 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRTAP10-3P60369 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRTAP10-3P60369 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KRTAP10-3P60369 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRTAP10-3P60369 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRTAP10-3P60369 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRTAP10-3P60369 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRTAP10-3P60369 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRTAP10-3P60369 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KRTAP10-3P60369 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRTAP10-3P60369 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRTAP10-3P60369 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRTAP10-3P60369 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRTAP10-3P60369 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRTAP10-3P60369 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KRTAP10-3P60369 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRTAP10-3P60369 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRTAP10-3P60369 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRTAP10-3P60369 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KRTAP10-3P60369 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRTAP10-3P60369 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRTAP10-3P60369 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRTAP10-3P60369 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRTAP10-3P60369 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRTAP10-3P60369 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KRTAP10-3P60369 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRTAP10-3P60369 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRTAP10-3P60369 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRTAP10-3P60369 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRTAP10-3P60369 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRTAP10-3P60369 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRTAP10-3P60369 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRTAP10-3P60369 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRTAP10-3P60369 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRTAP10-3P60369 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRTAP10-3P60369 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRTAP10-3P60369 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KRTAP10-3P60369 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRTAP10-3P60369 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRTAP10-3P60369 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRTAP10-3P60369 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRTAP10-3P60369 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRTAP10-3P60369 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRTAP10-3P60369 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRTAP10-3P60369 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRTAP10-3P60369 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRTAP10-3P60369 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KRTAP10-3P60369 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRTAP10-3P60369 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRTAP10-3P60369 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRTAP10-3P60369 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRTAP10-3P60369 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRTAP10-3P60369 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRTAP10-3P60369 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KRTAP10-3P60369 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRTAP10-3P60369 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRTAP10-3P60369 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRTAP10-3P60369 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRTAP10-3P60369 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRTAP10-3P60369 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRTAP10-3P60369 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRTAP10-3P60369 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRTAP10-3P60369 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRTAP10-3P60369 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRTAP10-3P60369 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KRTAP10-3P60369 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRTAP10-3P60369 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRTAP10-3P60369 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRTAP10-3P60369 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRTAP10-3P60369 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRTAP10-3P60369 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KRTAP10-3P60369 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRTAP10-3P60369 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRTAP10-3P60369 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRTAP10-3P60369 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRTAP10-3P60369 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRTAP10-3P60369 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KRTAP10-3P60369 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRTAP10-3P60369 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRTAP10-3P60369 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms