Protein–RNA interactions for Protein: P57073

SOX8, Transcription factor SOX-8, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX8P57073 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SOX8P57073 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SOX8P57073 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SOX8P57073 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SOX8P57073 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SOX8P57073 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SOX8P57073 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SOX8P57073 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SOX8P57073 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SOX8P57073 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SOX8P57073 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SOX8P57073 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SOX8P57073 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SOX8P57073 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SOX8P57073 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SOX8P57073 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SOX8P57073 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SOX8P57073 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SOX8P57073 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SOX8P57073 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SOX8P57073 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SOX8P57073 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SOX8P57073 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SOX8P57073 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SOX8P57073 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SOX8P57073 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SOX8P57073 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SOX8P57073 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SOX8P57073 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SOX8P57073 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SOX8P57073 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SOX8P57073 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SOX8P57073 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SOX8P57073 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SOX8P57073 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SOX8P57073 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SOX8P57073 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SOX8P57073 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SOX8P57073 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SOX8P57073 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SOX8P57073 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SOX8P57073 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SOX8P57073 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SOX8P57073 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SOX8P57073 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SOX8P57073 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SOX8P57073 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SOX8P57073 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SOX8P57073 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SOX8P57073 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SOX8P57073 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SOX8P57073 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SOX8P57073 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SOX8P57073 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SOX8P57073 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SOX8P57073 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SOX8P57073 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SOX8P57073 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SOX8P57073 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SOX8P57073 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SOX8P57073 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SOX8P57073 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SOX8P57073 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SOX8P57073 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SOX8P57073 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SOX8P57073 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SOX8P57073 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SOX8P57073 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SOX8P57073 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SOX8P57073 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SOX8P57073 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SOX8P57073 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SOX8P57073 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SOX8P57073 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SOX8P57073 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SOX8P57073 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SOX8P57073 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SOX8P57073 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SOX8P57073 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SOX8P57073 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SOX8P57073 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SOX8P57073 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SOX8P57073 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SOX8P57073 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SOX8P57073 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SOX8P57073 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SOX8P57073 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SOX8P57073 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SOX8P57073 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SOX8P57073 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SOX8P57073 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SOX8P57073 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SOX8P57073 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SOX8P57073 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SOX8P57073 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SOX8P57073 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SOX8P57073 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SOX8P57073 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SOX8P57073 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SOX8P57073 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms