Protein–RNA interactions for Protein: P57055

RIPPLY3, Protein ripply3, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3P57055 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RIPPLY3P57055 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RIPPLY3P57055 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RIPPLY3P57055 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RIPPLY3P57055 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RIPPLY3P57055 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIPPLY3P57055 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIPPLY3P57055 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RIPPLY3P57055 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIPPLY3P57055 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RIPPLY3P57055 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIPPLY3P57055 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIPPLY3P57055 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RIPPLY3P57055 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIPPLY3P57055 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RIPPLY3P57055 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RIPPLY3P57055 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RIPPLY3P57055 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RIPPLY3P57055 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RIPPLY3P57055 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIPPLY3P57055 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIPPLY3P57055 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RIPPLY3P57055 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RIPPLY3P57055 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RIPPLY3P57055 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RIPPLY3P57055 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIPPLY3P57055 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIPPLY3P57055 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RIPPLY3P57055 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RIPPLY3P57055 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIPPLY3P57055 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIPPLY3P57055 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RIPPLY3P57055 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIPPLY3P57055 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIPPLY3P57055 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIPPLY3P57055 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIPPLY3P57055 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RIPPLY3P57055 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RIPPLY3P57055 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RIPPLY3P57055 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RIPPLY3P57055 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIPPLY3P57055 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIPPLY3P57055 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIPPLY3P57055 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIPPLY3P57055 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIPPLY3P57055 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIPPLY3P57055 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIPPLY3P57055 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIPPLY3P57055 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIPPLY3P57055 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIPPLY3P57055 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIPPLY3P57055 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIPPLY3P57055 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RIPPLY3P57055 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RIPPLY3P57055 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIPPLY3P57055 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIPPLY3P57055 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIPPLY3P57055 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIPPLY3P57055 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIPPLY3P57055 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIPPLY3P57055 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIPPLY3P57055 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIPPLY3P57055 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIPPLY3P57055 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RIPPLY3P57055 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RIPPLY3P57055 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RIPPLY3P57055 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RIPPLY3P57055 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RIPPLY3P57055 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RIPPLY3P57055 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RIPPLY3P57055 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RIPPLY3P57055 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RIPPLY3P57055 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RIPPLY3P57055 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RIPPLY3P57055 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RIPPLY3P57055 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIPPLY3P57055 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RIPPLY3P57055 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RIPPLY3P57055 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RIPPLY3P57055 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RIPPLY3P57055 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RIPPLY3P57055 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RIPPLY3P57055 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RIPPLY3P57055 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RIPPLY3P57055 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RIPPLY3P57055 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RIPPLY3P57055 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RIPPLY3P57055 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RIPPLY3P57055 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RIPPLY3P57055 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RIPPLY3P57055 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RIPPLY3P57055 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RIPPLY3P57055 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RIPPLY3P57055 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RIPPLY3P57055 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RIPPLY3P57055 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RIPPLY3P57055 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RIPPLY3P57055 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RIPPLY3P57055 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RIPPLY3P57055 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms