Protein–RNA interactions for Protein: P55291

CDH15, Cadherin-15, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH15P55291 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDH15P55291 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDH15P55291 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDH15P55291 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDH15P55291 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDH15P55291 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDH15P55291 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDH15P55291 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDH15P55291 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDH15P55291 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDH15P55291 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDH15P55291 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDH15P55291 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDH15P55291 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDH15P55291 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDH15P55291 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDH15P55291 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDH15P55291 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDH15P55291 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDH15P55291 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDH15P55291 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDH15P55291 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDH15P55291 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDH15P55291 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDH15P55291 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDH15P55291 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDH15P55291 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
CDH15P55291 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDH15P55291 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDH15P55291 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDH15P55291 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDH15P55291 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDH15P55291 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.84
CDH15P55291 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDH15P55291 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDH15P55291 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDH15P55291 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDH15P55291 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDH15P55291 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDH15P55291 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDH15P55291 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDH15P55291 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDH15P55291 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDH15P55291 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDH15P55291 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDH15P55291 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDH15P55291 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDH15P55291 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDH15P55291 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDH15P55291 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDH15P55291 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDH15P55291 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDH15P55291 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDH15P55291 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDH15P55291 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDH15P55291 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDH15P55291 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDH15P55291 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDH15P55291 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDH15P55291 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDH15P55291 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDH15P55291 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDH15P55291 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
CDH15P55291 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDH15P55291 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDH15P55291 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDH15P55291 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDH15P55291 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDH15P55291 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDH15P55291 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDH15P55291 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDH15P55291 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDH15P55291 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDH15P55291 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDH15P55291 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDH15P55291 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDH15P55291 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDH15P55291 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDH15P55291 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDH15P55291 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDH15P55291 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDH15P55291 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDH15P55291 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CDH15P55291 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDH15P55291 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDH15P55291 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDH15P55291 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDH15P55291 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDH15P55291 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDH15P55291 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDH15P55291 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CDH15P55291 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDH15P55291 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDH15P55291 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDH15P55291 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDH15P55291 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CDH15P55291 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDH15P55291 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDH15P55291 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDH15P55291 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms