Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAD23AP54725 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAD23AP54725 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAD23AP54725 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAD23AP54725 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAD23AP54725 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAD23AP54725 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAD23AP54725 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAD23AP54725 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAD23AP54725 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAD23AP54725 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAD23AP54725 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
RAD23AP54725 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAD23AP54725 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RAD23AP54725 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RAD23AP54725 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RAD23AP54725 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAD23AP54725 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RAD23AP54725 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RAD23AP54725 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAD23AP54725 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAD23AP54725 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAD23AP54725 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAD23AP54725 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAD23AP54725 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAD23AP54725 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAD23AP54725 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAD23AP54725 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
RAD23AP54725 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RAD23AP54725 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAD23AP54725 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAD23AP54725 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAD23AP54725 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RAD23AP54725 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAD23AP54725 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAD23AP54725 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAD23AP54725 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAD23AP54725 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAD23AP54725 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAD23AP54725 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAD23AP54725 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAD23AP54725 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAD23AP54725 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RAD23AP54725 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAD23AP54725 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAD23AP54725 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAD23AP54725 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAD23AP54725 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAD23AP54725 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAD23AP54725 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAD23AP54725 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAD23AP54725 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAD23AP54725 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAD23AP54725 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAD23AP54725 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAD23AP54725 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAD23AP54725 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAD23AP54725 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAD23AP54725 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAD23AP54725 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAD23AP54725 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RAD23AP54725 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RAD23AP54725 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAD23AP54725 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAD23AP54725 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAD23AP54725 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RAD23AP54725 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAD23AP54725 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAD23AP54725 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAD23AP54725 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAD23AP54725 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAD23AP54725 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAD23AP54725 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAD23AP54725 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAD23AP54725 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAD23AP54725 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAD23AP54725 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAD23AP54725 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAD23AP54725 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAD23AP54725 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAD23AP54725 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAD23AP54725 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAD23AP54725 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAD23AP54725 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAD23AP54725 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAD23AP54725 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAD23AP54725 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAD23AP54725 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAD23AP54725 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAD23AP54725 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAD23AP54725 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAD23AP54725 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAD23AP54725 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAD23AP54725 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAD23AP54725 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAD23AP54725 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAD23AP54725 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAD23AP54725 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAD23AP54725 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAD23AP54725 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms