Protein–RNA interactions for Protein: P51788

CLCN2, Chloride channel protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN2P51788 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLCN2P51788 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CLCN2P51788 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CLCN2P51788 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLCN2P51788 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLCN2P51788 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLCN2P51788 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLCN2P51788 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLCN2P51788 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLCN2P51788 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLCN2P51788 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLCN2P51788 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CLCN2P51788 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLCN2P51788 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLCN2P51788 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLCN2P51788 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLCN2P51788 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLCN2P51788 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLCN2P51788 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLCN2P51788 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CLCN2P51788 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLCN2P51788 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLCN2P51788 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLCN2P51788 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLCN2P51788 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLCN2P51788 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CLCN2P51788 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CLCN2P51788 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLCN2P51788 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLCN2P51788 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLCN2P51788 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLCN2P51788 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLCN2P51788 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLCN2P51788 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLCN2P51788 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLCN2P51788 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLCN2P51788 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLCN2P51788 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLCN2P51788 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLCN2P51788 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLCN2P51788 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLCN2P51788 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLCN2P51788 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLCN2P51788 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLCN2P51788 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLCN2P51788 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLCN2P51788 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLCN2P51788 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLCN2P51788 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLCN2P51788 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLCN2P51788 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLCN2P51788 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLCN2P51788 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CLCN2P51788 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLCN2P51788 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLCN2P51788 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CLCN2P51788 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLCN2P51788 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLCN2P51788 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLCN2P51788 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CLCN2P51788 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLCN2P51788 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLCN2P51788 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLCN2P51788 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLCN2P51788 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLCN2P51788 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLCN2P51788 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLCN2P51788 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLCN2P51788 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLCN2P51788 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLCN2P51788 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLCN2P51788 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLCN2P51788 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLCN2P51788 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CLCN2P51788 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLCN2P51788 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLCN2P51788 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLCN2P51788 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLCN2P51788 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLCN2P51788 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLCN2P51788 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLCN2P51788 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLCN2P51788 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLCN2P51788 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLCN2P51788 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLCN2P51788 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CLCN2P51788 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLCN2P51788 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLCN2P51788 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLCN2P51788 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLCN2P51788 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLCN2P51788 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLCN2P51788 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLCN2P51788 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLCN2P51788 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLCN2P51788 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLCN2P51788 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CLCN2P51788 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLCN2P51788 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLCN2P51788 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms