Protein–RNA interactions for Protein: P51693

APLP1, Amyloid-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 650 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APLP1P51693 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
APLP1P51693 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
APLP1P51693 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
APLP1P51693 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC35.9■■■■□ 3.34
APLP1P51693 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
APLP1P51693 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
APLP1P51693 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
APLP1P51693 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
APLP1P51693 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
APLP1P51693 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
APLP1P51693 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
APLP1P51693 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC35.75■■■■□ 3.31
APLP1P51693 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC35.72■■■■□ 3.31
APLP1P51693 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
APLP1P51693 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
APLP1P51693 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
APLP1P51693 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
APLP1P51693 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
APLP1P51693 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
APLP1P51693 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
APLP1P51693 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
APLP1P51693 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
APLP1P51693 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
APLP1P51693 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
APLP1P51693 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
APLP1P51693 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
APLP1P51693 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
APLP1P51693 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
APLP1P51693 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
APLP1P51693 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
APLP1P51693 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
APLP1P51693 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
APLP1P51693 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
APLP1P51693 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
APLP1P51693 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
APLP1P51693 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
APLP1P51693 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
APLP1P51693 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
APLP1P51693 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
APLP1P51693 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
APLP1P51693 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
APLP1P51693 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
APLP1P51693 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
APLP1P51693 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
APLP1P51693 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
APLP1P51693 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
APLP1P51693 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
APLP1P51693 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
APLP1P51693 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
APLP1P51693 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
APLP1P51693 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
APLP1P51693 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
APLP1P51693 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
APLP1P51693 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
APLP1P51693 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
APLP1P51693 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
APLP1P51693 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
APLP1P51693 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
APLP1P51693 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
APLP1P51693 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.2
APLP1P51693 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
APLP1P51693 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC34.92■■■■□ 3.18
APLP1P51693 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
APLP1P51693 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
APLP1P51693 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
APLP1P51693 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
APLP1P51693 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
APLP1P51693 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
APLP1P51693 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
APLP1P51693 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
APLP1P51693 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
APLP1P51693 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
APLP1P51693 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
APLP1P51693 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
APLP1P51693 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
APLP1P51693 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
APLP1P51693 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
APLP1P51693 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
APLP1P51693 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
APLP1P51693 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
APLP1P51693 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
APLP1P51693 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
APLP1P51693 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
APLP1P51693 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
APLP1P51693 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.65■■■■□ 3.14
APLP1P51693 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
APLP1P51693 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
APLP1P51693 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
APLP1P51693 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
APLP1P51693 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
APLP1P51693 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
APLP1P51693 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
APLP1P51693 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
APLP1P51693 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
APLP1P51693 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
APLP1P51693 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
APLP1P51693 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
APLP1P51693 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.12
APLP1P51693 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
APLP1P51693 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms