Protein–RNA interactions for Protein: P51153

RAB13, Ras-related protein Rab-13, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB13P51153 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB13P51153 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB13P51153 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB13P51153 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB13P51153 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB13P51153 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB13P51153 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB13P51153 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB13P51153 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB13P51153 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB13P51153 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB13P51153 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB13P51153 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB13P51153 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB13P51153 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB13P51153 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB13P51153 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB13P51153 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB13P51153 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB13P51153 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB13P51153 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB13P51153 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB13P51153 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB13P51153 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB13P51153 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB13P51153 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB13P51153 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB13P51153 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB13P51153 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB13P51153 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB13P51153 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB13P51153 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB13P51153 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB13P51153 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB13P51153 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB13P51153 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB13P51153 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB13P51153 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB13P51153 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB13P51153 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB13P51153 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB13P51153 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB13P51153 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB13P51153 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB13P51153 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB13P51153 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB13P51153 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB13P51153 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB13P51153 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB13P51153 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB13P51153 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB13P51153 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB13P51153 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAB13P51153 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB13P51153 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB13P51153 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB13P51153 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB13P51153 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB13P51153 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB13P51153 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB13P51153 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB13P51153 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB13P51153 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB13P51153 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB13P51153 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB13P51153 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB13P51153 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB13P51153 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB13P51153 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB13P51153 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB13P51153 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB13P51153 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB13P51153 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB13P51153 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB13P51153 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB13P51153 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB13P51153 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB13P51153 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB13P51153 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
RAB13P51153 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB13P51153 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB13P51153 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB13P51153 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB13P51153 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB13P51153 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB13P51153 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB13P51153 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB13P51153 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB13P51153 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB13P51153 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB13P51153 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB13P51153 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB13P51153 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB13P51153 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB13P51153 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB13P51153 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB13P51153 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB13P51153 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB13P51153 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAB13P51153 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121 ms