Protein–RNA interactions for Protein: P51153

RAB13, Ras-related protein Rab-13, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB13P51153 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RAB13P51153 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAB13P51153 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAB13P51153 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAB13P51153 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RAB13P51153 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAB13P51153 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RAB13P51153 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAB13P51153 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAB13P51153 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAB13P51153 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAB13P51153 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAB13P51153 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAB13P51153 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAB13P51153 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAB13P51153 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAB13P51153 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAB13P51153 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAB13P51153 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB13P51153 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
RAB13P51153 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB13P51153 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB13P51153 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB13P51153 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB13P51153 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB13P51153 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB13P51153 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAB13P51153 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB13P51153 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB13P51153 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB13P51153 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB13P51153 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB13P51153 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB13P51153 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB13P51153 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB13P51153 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB13P51153 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB13P51153 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB13P51153 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB13P51153 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB13P51153 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB13P51153 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAB13P51153 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAB13P51153 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB13P51153 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB13P51153 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB13P51153 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RAB13P51153 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB13P51153 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB13P51153 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB13P51153 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB13P51153 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB13P51153 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB13P51153 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB13P51153 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB13P51153 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB13P51153 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB13P51153 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB13P51153 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB13P51153 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB13P51153 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB13P51153 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB13P51153 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB13P51153 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB13P51153 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB13P51153 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB13P51153 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB13P51153 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB13P51153 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB13P51153 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RAB13P51153 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB13P51153 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB13P51153 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB13P51153 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB13P51153 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB13P51153 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB13P51153 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB13P51153 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB13P51153 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB13P51153 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB13P51153 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB13P51153 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB13P51153 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB13P51153 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB13P51153 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB13P51153 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB13P51153 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB13P51153 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB13P51153 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB13P51153 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB13P51153 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB13P51153 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB13P51153 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB13P51153 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB13P51153 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB13P51153 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB13P51153 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB13P51153 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB13P51153 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB13P51153 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms