Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC46.58■■■■■ 5.05
NUP153P49790 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC46.57■■■■■ 5.05
NUP153P49790 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.54■■■■■ 5.04
NUP153P49790 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.48■■■■■ 5.03
NUP153P49790 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC46.46■■■■■ 5.03
NUP153P49790 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC46.45■■■■■ 5.03
NUP153P49790 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC46.44■■■■■ 5.03
NUP153P49790 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.41■■■■■ 5.02
NUP153P49790 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.4■■■■■ 5.02
NUP153P49790 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC46.4■■■■■ 5.02
NUP153P49790 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.36■■■■■ 5.01
NUP153P49790 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC46.33■■■■■ 5.01
NUP153P49790 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC46.32■■■■■ 5.01
NUP153P49790 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC46.25■■■■■ 5
NUP153P49790 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC46.24■■■■■ 4.99
NUP153P49790 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.12■■■■■ 4.97
NUP153P49790 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC46.12■■■■■ 4.97
NUP153P49790 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC46.12■■■■■ 4.97
NUP153P49790 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.11■■■■■ 4.97
NUP153P49790 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.1■■■■■ 4.97
NUP153P49790 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC46.1■■■■■ 4.97
NUP153P49790 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.07■■■■■ 4.96
NUP153P49790 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC46.03■■■■■ 4.96
NUP153P49790 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46■■■■■ 4.95
NUP153P49790 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.95■■■■■ 4.95
NUP153P49790 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC45.94■■■■■ 4.95
NUP153P49790 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC45.94■■■■■ 4.95
NUP153P49790 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC45.93■■■■■ 4.94
NUP153P49790 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC45.89■■■■■ 4.94
NUP153P49790 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC45.88■■■■■ 4.94
NUP153P49790 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.8■■■■■ 4.92
NUP153P49790 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC45.79■■■■■ 4.92
NUP153P49790 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.73■■■■■ 4.91
NUP153P49790 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC45.73■■■■■ 4.91
NUP153P49790 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.68■■■■■ 4.9
NUP153P49790 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC45.68■■■■■ 4.9
NUP153P49790 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC45.67■■■■■ 4.9
NUP153P49790 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC45.66■■■■■ 4.9
NUP153P49790 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.66■■■■■ 4.9
NUP153P49790 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.57■■■■■ 4.89
NUP153P49790 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.57■■■■■ 4.89
NUP153P49790 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC45.57■■■■■ 4.89
NUP153P49790 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
NUP153P49790 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
NUP153P49790 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC45.53■■■■■ 4.88
NUP153P49790 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC45.53■■■■■ 4.88
NUP153P49790 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC45.52■■■■■ 4.88
NUP153P49790 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC45.52■■■■■ 4.88
NUP153P49790 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.5■■■■■ 4.87
NUP153P49790 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC45.49■■■■■ 4.87
NUP153P49790 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.48■■■■■ 4.87
NUP153P49790 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC45.48■■■■■ 4.87
NUP153P49790 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC45.47■■■■■ 4.87
NUP153P49790 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.44■■■■■ 4.87
NUP153P49790 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC45.43■■■■■ 4.86
NUP153P49790 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC45.42■■■■■ 4.86
NUP153P49790 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.37■■■■■ 4.85
NUP153P49790 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC45.33■■■■■ 4.85
NUP153P49790 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC45.26■■■■■ 4.84
NUP153P49790 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC45.25■■■■■ 4.83
NUP153P49790 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.23■■■■■ 4.83
NUP153P49790 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.23■■■■■ 4.83
NUP153P49790 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC45.23■■■■■ 4.83
NUP153P49790 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.22■■■■■ 4.83
NUP153P49790 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.21■■■■■ 4.83
NUP153P49790 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC45.19■■■■■ 4.82
NUP153P49790 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC45.16■■■■■ 4.82
NUP153P49790 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC45.15■■■■■ 4.82
NUP153P49790 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.14■■■■■ 4.82
NUP153P49790 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
NUP153P49790 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC45.07■■■■■ 4.81
NUP153P49790 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.01■■■■■ 4.8
NUP153P49790 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC45■■■■■ 4.79
NUP153P49790 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC44.98■■■■■ 4.79
NUP153P49790 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC44.97■■■■■ 4.79
NUP153P49790 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.78
NUP153P49790 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.87■■■■■ 4.77
NUP153P49790 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC44.85■■■■■ 4.77
NUP153P49790 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.85■■■■■ 4.77
NUP153P49790 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
NUP153P49790 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC44.81■■■■■ 4.76
NUP153P49790 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.81■■■■■ 4.76
NUP153P49790 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
NUP153P49790 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
NUP153P49790 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.79■■■■■ 4.76
NUP153P49790 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
NUP153P49790 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC44.78■■■■■ 4.76
NUP153P49790 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
NUP153P49790 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.77■■■■■ 4.76
NUP153P49790 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.76■■■■■ 4.76
NUP153P49790 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC44.76■■■■■ 4.76
NUP153P49790 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.73■■■■■ 4.75
NUP153P49790 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC44.72■■■■■ 4.75
NUP153P49790 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
NUP153P49790 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC44.68■■■■■ 4.74
NUP153P49790 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.67■■■■■ 4.74
NUP153P49790 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC44.67■■■■■ 4.74
NUP153P49790 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
NUP153P49790 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
NUP153P49790 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.6■■■■■ 4.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms