Protein–RNA interactions for Protein: P49747

COMP, Cartilage oligomeric matrix protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMPP49747 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COMPP49747 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COMPP49747 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COMPP49747 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COMPP49747 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COMPP49747 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COMPP49747 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COMPP49747 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COMPP49747 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
COMPP49747 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COMPP49747 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COMPP49747 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COMPP49747 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COMPP49747 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COMPP49747 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COMPP49747 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COMPP49747 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COMPP49747 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COMPP49747 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COMPP49747 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COMPP49747 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COMPP49747 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COMPP49747 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COMPP49747 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COMPP49747 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COMPP49747 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
COMPP49747 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COMPP49747 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COMPP49747 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COMPP49747 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COMPP49747 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COMPP49747 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COMPP49747 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COMPP49747 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COMPP49747 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COMPP49747 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COMPP49747 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COMPP49747 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COMPP49747 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COMPP49747 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
COMPP49747 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
COMPP49747 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COMPP49747 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COMPP49747 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COMPP49747 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COMPP49747 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COMPP49747 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COMPP49747 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COMPP49747 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
COMPP49747 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COMPP49747 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COMPP49747 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COMPP49747 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COMPP49747 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COMPP49747 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COMPP49747 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COMPP49747 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COMPP49747 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COMPP49747 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
COMPP49747 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
COMPP49747 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COMPP49747 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COMPP49747 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COMPP49747 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COMPP49747 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COMPP49747 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COMPP49747 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COMPP49747 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
COMPP49747 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COMPP49747 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COMPP49747 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COMPP49747 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
COMPP49747 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23■■□□□ 1.27
COMPP49747 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
COMPP49747 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
COMPP49747 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COMPP49747 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COMPP49747 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COMPP49747 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COMPP49747 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COMPP49747 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COMPP49747 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COMPP49747 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COMPP49747 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COMPP49747 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COMPP49747 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COMPP49747 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COMPP49747 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COMPP49747 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COMPP49747 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COMPP49747 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COMPP49747 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COMPP49747 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COMPP49747 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COMPP49747 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COMPP49747 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COMPP49747 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COMPP49747 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COMPP49747 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COMPP49747 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms