Protein–RNA interactions for Protein: P49023

PXN, Paxillin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXNP49023 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PXNP49023 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PXNP49023 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PXNP49023 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PXNP49023 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PXNP49023 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PXNP49023 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PXNP49023 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PXNP49023 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
PXNP49023 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PXNP49023 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PXNP49023 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PXNP49023 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PXNP49023 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PXNP49023 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PXNP49023 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PXNP49023 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PXNP49023 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PXNP49023 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PXNP49023 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
PXNP49023 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PXNP49023 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PXNP49023 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PXNP49023 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PXNP49023 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PXNP49023 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PXNP49023 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PXNP49023 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PXNP49023 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
PXNP49023 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PXNP49023 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PXNP49023 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PXNP49023 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PXNP49023 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PXNP49023 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PXNP49023 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PXNP49023 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PXNP49023 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PXNP49023 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PXNP49023 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
PXNP49023 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
PXNP49023 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PXNP49023 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PXNP49023 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PXNP49023 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PXNP49023 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PXNP49023 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PXNP49023 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PXNP49023 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
PXNP49023 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
PXNP49023 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PXNP49023 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PXNP49023 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PXNP49023 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PXNP49023 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PXNP49023 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PXNP49023 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PXNP49023 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PXNP49023 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PXNP49023 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PXNP49023 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PXNP49023 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PXNP49023 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PXNP49023 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PXNP49023 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PXNP49023 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PXNP49023 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PXNP49023 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PXNP49023 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PXNP49023 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PXNP49023 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PXNP49023 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PXNP49023 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PXNP49023 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PXNP49023 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PXNP49023 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PXNP49023 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PXNP49023 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PXNP49023 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
PXNP49023 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PXNP49023 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PXNP49023 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PXNP49023 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
PXNP49023 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PXNP49023 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PXNP49023 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PXNP49023 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PXNP49023 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PXNP49023 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PXNP49023 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PXNP49023 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PXNP49023 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
PXNP49023 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PXNP49023 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PXNP49023 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PXNP49023 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PXNP49023 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PXNP49023 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PXNP49023 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PXNP49023 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms