Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NR4A2P43354 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NR4A2P43354 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NR4A2P43354 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NR4A2P43354 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NR4A2P43354 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NR4A2P43354 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NR4A2P43354 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NR4A2P43354 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NR4A2P43354 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NR4A2P43354 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NR4A2P43354 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NR4A2P43354 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NR4A2P43354 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NR4A2P43354 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NR4A2P43354 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NR4A2P43354 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NR4A2P43354 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NR4A2P43354 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NR4A2P43354 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NR4A2P43354 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NR4A2P43354 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NR4A2P43354 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NR4A2P43354 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NR4A2P43354 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NR4A2P43354 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NR4A2P43354 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NR4A2P43354 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NR4A2P43354 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NR4A2P43354 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NR4A2P43354 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NR4A2P43354 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NR4A2P43354 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NR4A2P43354 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NR4A2P43354 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NR4A2P43354 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NR4A2P43354 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NR4A2P43354 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NR4A2P43354 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NR4A2P43354 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NR4A2P43354 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NR4A2P43354 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NR4A2P43354 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NR4A2P43354 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NR4A2P43354 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NR4A2P43354 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NR4A2P43354 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NR4A2P43354 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NR4A2P43354 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NR4A2P43354 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NR4A2P43354 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NR4A2P43354 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NR4A2P43354 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NR4A2P43354 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NR4A2P43354 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NR4A2P43354 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NR4A2P43354 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NR4A2P43354 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NR4A2P43354 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NR4A2P43354 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NR4A2P43354 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NR4A2P43354 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NR4A2P43354 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NR4A2P43354 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NR4A2P43354 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NR4A2P43354 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NR4A2P43354 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NR4A2P43354 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NR4A2P43354 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NR4A2P43354 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NR4A2P43354 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NR4A2P43354 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NR4A2P43354 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NR4A2P43354 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NR4A2P43354 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NR4A2P43354 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NR4A2P43354 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NR4A2P43354 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NR4A2P43354 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NR4A2P43354 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NR4A2P43354 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NR4A2P43354 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NR4A2P43354 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NR4A2P43354 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NR4A2P43354 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NR4A2P43354 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NR4A2P43354 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NR4A2P43354 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NR4A2P43354 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
NR4A2P43354 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NR4A2P43354 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NR4A2P43354 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NR4A2P43354 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NR4A2P43354 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NR4A2P43354 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NR4A2P43354 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NR4A2P43354 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NR4A2P43354 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NR4A2P43354 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NR4A2P43354 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms