Protein–RNA interactions for Protein: P37840

SNCA, Alpha-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCAP37840 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNCAP37840 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNCAP37840 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNCAP37840 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNCAP37840 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNCAP37840 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNCAP37840 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNCAP37840 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SNCAP37840 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNCAP37840 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNCAP37840 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNCAP37840 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNCAP37840 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNCAP37840 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNCAP37840 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNCAP37840 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNCAP37840 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNCAP37840 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNCAP37840 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNCAP37840 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNCAP37840 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNCAP37840 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNCAP37840 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNCAP37840 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNCAP37840 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNCAP37840 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNCAP37840 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNCAP37840 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNCAP37840 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNCAP37840 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNCAP37840 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNCAP37840 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNCAP37840 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNCAP37840 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNCAP37840 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNCAP37840 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNCAP37840 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNCAP37840 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNCAP37840 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNCAP37840 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNCAP37840 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNCAP37840 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNCAP37840 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNCAP37840 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNCAP37840 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SNCAP37840 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNCAP37840 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNCAP37840 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNCAP37840 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNCAP37840 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNCAP37840 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNCAP37840 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNCAP37840 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNCAP37840 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNCAP37840 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNCAP37840 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNCAP37840 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNCAP37840 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNCAP37840 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNCAP37840 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNCAP37840 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNCAP37840 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNCAP37840 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNCAP37840 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNCAP37840 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNCAP37840 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNCAP37840 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNCAP37840 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNCAP37840 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNCAP37840 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNCAP37840 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNCAP37840 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNCAP37840 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNCAP37840 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNCAP37840 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNCAP37840 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SNCAP37840 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNCAP37840 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNCAP37840 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNCAP37840 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNCAP37840 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNCAP37840 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNCAP37840 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNCAP37840 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNCAP37840 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNCAP37840 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNCAP37840 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SNCAP37840 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNCAP37840 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNCAP37840 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNCAP37840 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNCAP37840 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNCAP37840 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNCAP37840 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNCAP37840 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNCAP37840 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNCAP37840 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNCAP37840 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNCAP37840 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNCAP37840 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms